101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1276 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1276  putative inositol 1-phosphate synthase  100 
 
 		 380 aa  783    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9365  putative myo-inositol-1-phosphate synthase  74.44 
 
 		 359 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.279573  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2138  myo-inositol-1-phosphate synthase  74.44 
 
 		 359 aa  548  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4958  inositol 1-phosphate synthase  73.88 
 
 		 359 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3568  inositol 1-phosphate synthase  73.6 
 
 		 359 aa  550  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.988412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7031  inositol 1-phosphate synthase  73.6 
 
 		 363 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5081  myo-inositol-1-phosphate synthase  72.39 
 
 		 359 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4563  myo-inositol-1-phosphate synthase  71.27 
 
 		 359 aa  537  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459247  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23300  myo-inositol-1-phosphate synthase  73.24 
 
 		 361 aa  540  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3099  myo-inositol-1-phosphate synthase  71.35 
 
 		 359 aa  537  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3359  inositol 1-phosphate synthase  73.96 
 
 		 364 aa  536  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26610  inositol 1-phosphate synthase  71.99 
 
 		 359 aa  532  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5384  inositol 1-phosphate synthase  73.03 
 
 		 359 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4846  inositol 1-phosphate synthase  71.88 
 
 		 363 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4678  myo-inositol-1-phosphate synthase  71.79 
 
 		 361 aa  531  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7318  myo-inositol-1-phosphate synthase  73.22 
 
 		 357 aa  528  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4201  inositol 1-phosphate synthase  73.16 
 
 		 357 aa  528  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2528  inositol 1-phosphate synthase  71.11 
 
 		 363 aa  530  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4529  myo-inositol-1-phosphate synthase  72.93 
 
 		 357 aa  526  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0037  Myo-inositol-1-phosphate synthase  70.51 
 
 		 359 aa  526  1e-148  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0291539  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37840  inositol 1-phosphate synthase  70.56 
 
 		 363 aa  524  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5074  inositol 1-phosphate synthase  70.22 
 
 		 359 aa  519  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.491686  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3703  inositol 1-phosphate synthase  71.19 
 
 		 364 aa  521  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5376  myo-inositol-1-phosphate synthase  71.88 
 
 		 359 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.816285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5465  myo-inositol-1-phosphate synthase  71.88 
 
 		 359 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0339184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6040  myo-inositol-1-phosphate synthase  71.07 
 
 		 362 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5752  myo-inositol-1-phosphate synthase  71.88 
 
 		 359 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780572  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0867  myo-inositol-1-phosphate synthase  70.22 
 
 		 362 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3509  Myo-inositol-1-phosphate synthase  70.7 
 
 		 360 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0347  inositol 1-phosphate synthase  71.07 
 
 		 359 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.745624  normal  0.0558836 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39310  inositol 1-phosphate synthase  70.14 
 
 		 362 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4748  inositol 1-phosphate synthase  71.75 
 
 		 363 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5921  Myo-inositol-1-phosphate synthase  69.1 
 
 		 359 aa  517  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2905  myo-inositol-1-phosphate synthase  70.42 
 
 		 388 aa  512  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10045  myo-inositol-1-phosphate synthase ino1  71.31 
 
 		 367 aa  511  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.723979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4195  inositol 1-phosphate synthase  71.07 
 
 		 370 aa  510  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2614  inositol 1-phosphate synthase  69.86 
 
 		 361 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0149613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1794  Myo-inositol-1-phosphate synthase  64.33 
 
 		 361 aa  479  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0509898  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3883  myo-inositol-1-phosphate synthase  63.31 
 
 		 367 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0394  Myo-inositol-1-phosphate synthase  64.02 
 
 		 402 aa  475  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3367  myo-inositol-1-phosphate synthase  62.61 
 
 		 381 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00885843  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2585  myo-inositol-1-phosphate synthase  64.04 
 
 		 362 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4642  Myo-inositol-1-phosphate synthase  63.76 
 
 		 362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00394531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1160  myo-inositol-1-phosphate synthase  63.07 
 
 		 356 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0979  myo-inositol-1-phosphate synthase family protein  62 
 
 		 370 aa  464  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00718854  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0870  myo-inositol-1-phosphate synthase  62 
 
 		 370 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0382  myo-inositol-1-phosphate synthase  62.78 
 
 		 356 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.196157  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_852  myo-inositol-1-phosphate synthase  61.71 
 
 		 370 aa  462  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000625636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2694  myo-inositol-1-phosphate synthase  61.76 
 
 		 571 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0790  Myo-inositol-1-phosphate synthase  61.54 
 
 		 390 aa  454  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0238913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1314  myo-inositol-1-phosphate synthase  62.32 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0503  myo-inositol-1-phosphate synthase  59.49 
 
 		 363 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1263  Myo-inositol-1-phosphate synthase  59.49 
 
 		 363 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0100995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0243  myo-inositol-1-phosphate synthase  59.6 
 
 		 365 aa  431  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.121242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0189  Myo-inositol-1-phosphate synthase  59.89 
 
 		 365 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0258  Myo-inositol-1-phosphate synthase  56.23 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1040  myo-inositol-1-phosphate synthase  56.04 
 
 		 366 aa  412  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0276  myo-inositol-1-phosphate synthase  56.58 
 
 		 369 aa  411  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2381  myo-inositol-1-phosphate synthase  54.67 
 
 		 367 aa  401  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0974  myo-inositol-1-phosphate synthase  54.97 
 
 		 367 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.505463  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0676  Myo-inositol-1-phosphate synthase  51.23 
 
 		 365 aa  388  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.639702  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0101  myo-inositol-1-phosphate synthase  52.38 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1378  Myo-inositol-1-phosphate synthase  51.81 
 
 		 375 aa  371  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2981  myo-inositol-1-phosphate synthase  49.58 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0649  myo-inositol-1-phosphate synthase  42.66 
 
 		 364 aa  323  2e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1868  Myo-inositol-1-phosphate synthase  45.82 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1693  myo-inositol-1-phosphate synthase  46.15 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.23989 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0544  myo-inositol-1-phosphate synthase  43.18 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3127  Myo-inositol-1-phosphate synthase  42.58 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1653  myo-inositol-1-phosphate synthase  39.83 
 
 		 354 aa  262  6e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.470823  hitchhiker  0.00129381 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1718  myo-inositol-1-phosphate synthase  40.17 
 
 		 351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.537693  normal  0.11872 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0738  myo-inositol-1-phosphate synthase  41.29 
 
 		 351 aa  251  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0753  myo-inositol-1-phosphate synthase  41.85 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.170909 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1904  L-myo-inositol-1-phosphate synthase  39.7 
 
 		 341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0868076 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1307  Myo-inositol-1-phosphate synthase  37.24 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.74041  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1313  myo-inositol-1-phosphate synthase  28.31 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00015113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1373  myo-inositol-1-phosphate synthase  28.57 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0205603  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1660  myo-inositol-1-phosphate synthase  28.57 
 
 		 387 aa  87.4  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3598  inositol-3-phosphate synthase  25.59 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000452081 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1982  inositol-3-phosphate synthase  32.84 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2291  inositol-3-phosphate synthase  28.76 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.0325155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2801  Inositol-3-phosphate synthase  28.06 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2906  Inositol-3-phosphate synthase  28.06 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.0937533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1026  Inositol-3-phosphate synthase  28.12 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267394  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2679  inositol-3-phosphate synthase  28.06 
 
 		 423 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2324  Inositol-3-phosphate synthase  29.8 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0365735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2332  Inositol-3-phosphate synthase  26.37 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2420  Inositol-3-phosphate synthase  26.37 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0243061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1535  inositol-3-phosphate synthase  26.37 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0777  Myo-inositol-1-phosphate synthase  29.13 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.285259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1734  inositol-3-phosphate synthase  24.63 
 
 		 448 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11090  myo-inositol-1-phosphate synthase  27.75 
 
 		 382 aa  52.8  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.417407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2277  inositol-3-phosphate synthase  24.38 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45120  predicted protein  27.44 
 
 		 530 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0929469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2530  inositol-3-phosphate synthase  23.96 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1797  Inositol-3-phosphate synthase  26.19 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4149  inositol-3-phosphate synthase  23.83 
 
 		 435 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4280  Inositol-3-phosphate synthase  23.83 
 
 		 435 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4302  Inositol-3-phosphate synthase  23.83 
 
 		 435 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2400  Inositol-3-phosphate synthase  22.81 
 
 		 441 aa  46.2  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.663346  normal  0.130983 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>