More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1237 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  100 
 
 		 262 aa  540  1e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  49.17 
 
 		 247 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  47.97 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  46.99 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2381  ABC transporter related protein  45.24 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722045  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  41.7 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  42.92 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  42.68 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  39.39 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  42.22 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  40.81 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  39.63 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  41.33 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  37.77 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  38.6 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  41.33 
 
 		 275 aa  179  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  39.91 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  43.12 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  38.93 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  38.93 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  40.18 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  42.59 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 		 249 aa  174  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 		 249 aa  174  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  40.64 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  40.64 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  40.64 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  44.23 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  38.43 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  42.99 
 
 		 292 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  37.87 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  37.83 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 		 261 aa  172  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  38.66 
 
 		 289 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  37.56 
 
 		 266 aa  171  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  43.08 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  38.01 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  37.99 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  38.1 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  37.15 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  41.59 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  42.15 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  42.15 
 
 		 297 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  38.72 
 
 		 266 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  40.47 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  37.99 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  43.72 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  41.87 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  39.27 
 
 		 296 aa  168  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0602  ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 		 254 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  40.37 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.06 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  40 
 
 		 296 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  42.2 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  38.3 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  40.26 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  37.16 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  42.29 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  38.57 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  35.19 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3370  ABC transporter-related protein  37.13 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  35.59 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  38.12 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  36.78 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  39.04 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06581  ABC transporter ATP-binding protein  35.59 
 
 		 254 aa  164  9e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505293  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  39.41 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  40.4 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  40.1 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  40.18 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  42.52 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  38.72 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  36.76 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  36.8 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06671  ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  37.28 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  36.84 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.04 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  40 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  41.92 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.04 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.04 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  35.62 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  39.49 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  40 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.04 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  38.79 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  40.1 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3051  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.04 
 
 		 273 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0128316 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0298  ABC transporter related  37.1 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0303285  normal  0.0473701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3453  ABC transporter related  41.47 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.859541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  42.27 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  41.54 
 
 		 246 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  37.19 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>