159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1200 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  100 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  47.06 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  36.36 
 
 		 192 aa  95.5  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  35.38 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  33.33 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  36.52 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  34.08 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  32.79 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  32.24 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  35.71 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  38.06 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  32.79 
 
 		 191 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  38.93 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  32.07 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  34.57 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  42.61 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  34.57 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  33.92 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  33.33 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  47.62 
 
 		 182 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  33.95 
 
 		 184 aa  72  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  34.25 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  30.05 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  30.05 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  33.33 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  29.51 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  32.74 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  37.41 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  32.92 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  32.4 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  35.95 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  32.45 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  45.16 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  45.16 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  30 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  32.26 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  44.58 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  30.46 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  35.71 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  33.33 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  39.22 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  47.06 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  34.69 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  44.58 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  36 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  36 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  31.78 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  32.14 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  31.95 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  32.09 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  31.33 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  32.9 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  34.43 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  34.43 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  27.92 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  27.92 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  42.35 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  29.08 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  29.08 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  28.93 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  34.97 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  30.43 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  33.76 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  33.33 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  34.46 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  32 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  30.19 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  31.67 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  45.24 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  39.76 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  47.83 
 
 		 169 aa  62  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  32 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  36.62 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  30.07 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  33.33 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  34.16 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  28.64 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  32 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  34.62 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  34.62 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  34.62 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  41.98 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  52.94 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  49.28 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  27.52 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  33.54 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  33.14 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  34.62 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  33.33 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  26.7 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  31.58 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  29.01 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  29.52 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  38.36 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  32.12 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  31.28 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  31.28 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  31.28 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  37.27 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>