More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1182 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 418 aa  861    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  62.04 
 
 		 422 aa  507  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0209  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  56.09 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  53.83 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5476  ABC transporter related protein  51.25 
 
 		 413 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  47.23 
 
 		 250 aa  246  8e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  37.26 
 
 		 424 aa  236  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  35.82 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  46.41 
 
 		 254 aa  228  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1066  ABC transporter related  48.73 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  44.96 
 
 		 649 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  42.86 
 
 		 244 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  45.38 
 
 		 443 aa  223  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  35.55 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  36.69 
 
 		 429 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  43.8 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  45.83 
 
 		 870 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  44.26 
 
 		 468 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  43.2 
 
 		 605 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  43.72 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  37.5 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  41.38 
 
 		 390 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  42.97 
 
 		 424 aa  216  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.96 
 
 		 454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  45.3 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  43.93 
 
 		 415 aa  216  8e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  47 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  41.6 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  43.24 
 
 		 437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 		 422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  44.1 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  46.56 
 
 		 449 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  45.31 
 
 		 431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  42.58 
 
 		 416 aa  212  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  42.68 
 
 		 438 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  50 
 
 		 429 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  41.11 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  45.34 
 
 		 254 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  44.08 
 
 		 488 aa  210  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  48.08 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  45.34 
 
 		 254 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 465 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 465 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 471 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 465 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  43.1 
 
 		 242 aa  210  4e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 465 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  43.64 
 
 		 254 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  46.7 
 
 		 418 aa  209  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  43.15 
 
 		 254 aa  209  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 465 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 245 aa  209  8e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  43.03 
 
 		 410 aa  209  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 469 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  44.92 
 
 		 254 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  42.67 
 
 		 256 aa  208  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  41.09 
 
 		 433 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4190  ABC transporter related  45.38 
 
 		 246 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  44.86 
 
 		 424 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  48.51 
 
 		 411 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  42.79 
 
 		 241 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  45.75 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  41.08 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  47.34 
 
 		 439 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  44.55 
 
 		 427 aa  206  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  47.64 
 
 		 427 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  45.45 
 
 		 369 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  42.49 
 
 		 241 aa  206  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  43.75 
 
 		 711 aa  205  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  41.44 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  35.92 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  45.5 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  42.46 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  42.37 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  46.67 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  43.04 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  45.45 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  40.96 
 
 		 816 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  41.18 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  40.16 
 
 		 493 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  38.56 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  43.51 
 
 		 472 aa  203  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  38.26 
 
 		 433 aa  202  7e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  36.88 
 
 		 395 aa  202  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  46.22 
 
 		 456 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  35.14 
 
 		 420 aa  202  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  39.08 
 
 		 420 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  35.31 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  40.86 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  45.54 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  41.81 
 
 		 261 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  41.39 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  37.04 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  42.08 
 
 		 247 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>