More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1097 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1097  ribosomal protein S7  100 
 
 
156 aa  319  8e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0854  30S ribosomal protein S7  91.67 
 
 
156 aa  296  5e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.633412  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0623  ribosomal protein S7  78.85 
 
 
156 aa  258  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29800  SSU ribosomal protein S7P  79.49 
 
 
156 aa  255  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0583  ribosomal protein S7  76.92 
 
 
156 aa  254  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.139613  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2663  ribosomal protein S7  76.28 
 
 
156 aa  254  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  78.21 
 
 
156 aa  254  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 
156 aa  250  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  76.28 
 
 
156 aa  250  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  76.28 
 
 
156 aa  250  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  76.92 
 
 
156 aa  249  7e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  76.28 
 
 
156 aa  250  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 
156 aa  249  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23890  SSU ribosomal protein S7P  74.36 
 
 
156 aa  249  9.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0482978  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1181  30S ribosomal protein S7  74.36 
 
 
156 aa  248  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458532  normal  0.0579961 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3468  ribosomal protein S7  75 
 
 
156 aa  246  8e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 
156 aa  246  9e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1116  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 
156 aa  245  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3147  ribosomal protein S7  72.44 
 
 
156 aa  245  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.965712  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17220  30S ribosomal protein S7  74.36 
 
 
156 aa  244  3e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2694  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 
156 aa  244  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  72.44 
 
 
156 aa  243  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0578  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 
156 aa  242  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6618  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 
156 aa  241  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2981  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 
156 aa  242  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6053  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 
156 aa  240  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5120  ribosomal protein S7  70.51 
 
 
156 aa  239  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4511  ribosomal protein S7  71.15 
 
 
156 aa  239  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2650  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  238  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0683  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 
156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4319  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 
156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.571131  hitchhiker  0.0043079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3927  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 
156 aa  237  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481009  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1082  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 
156 aa  236  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0922  ribosomal protein S7  70.51 
 
 
156 aa  236  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03940  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 
156 aa  234  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0558  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 
156 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378415  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0302  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 
156 aa  231  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3924  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 
156 aa  228  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 
156 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0394  ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.633784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  214  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  213  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  213  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  213  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  213  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  213  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  213  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  213  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  213  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000269779  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  60.9 
 
 
156 aa  207  4e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000189839  hitchhiker  0.0000425179 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  207  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  207  5e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  207  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  206  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  206  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  205  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  59.87 
 
 
157 aa  205  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  204  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  204  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  203  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  202  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 
155 aa  202  1e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  201  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  202  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  202  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  201  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  201  3e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2822  30S ribosomal protein S7  62.76 
 
 
156 aa  201  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0935176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  201  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  200  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  200  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  200  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  200  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  200  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  200  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
155 aa  200  7e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  200  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  200  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  200  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  200  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  199  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  199  9e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
155 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  197  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  198  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>