97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1062 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 
1227 aa  2494    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0942  lipoprotein  29.48 
 
 
741 aa  173  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00629705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2784  lipoprotein  33.65 
 
 
486 aa  171  7e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491799  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  29.35 
 
 
2415 aa  169  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  35.26 
 
 
857 aa  160  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  31.87 
 
 
862 aa  157  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl446  membrane-associated lipoprotein precurser  29.4 
 
 
907 aa  157  2e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150893  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2789  lipoprotein  34.03 
 
 
395 aa  151  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0944  lipoprotein  27.3 
 
 
609 aa  147  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.528122  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46561  predicted protein  29.78 
 
 
500 aa  147  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0924573  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  29.49 
 
 
898 aa  145  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  32.83 
 
 
862 aa  144  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40634  predicted protein  32.88 
 
 
1038 aa  141  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  33.96 
 
 
2670 aa  132  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0300  hypothetical protein  28.6 
 
 
497 aa  132  5.0000000000000004e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.39136  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43047  predicted protein  27.8 
 
 
399 aa  128  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199168  normal  0.21868 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  34.75 
 
 
800 aa  128  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33739  predicted protein  29.21 
 
 
331 aa  128  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.39925  hitchhiker  0.0000589113 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08600  surface protein 26-residue repeat-containing protein  30.39 
 
 
414 aa  127  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.14343  hitchhiker  0.0000116306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  31.42 
 
 
634 aa  127  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  27.71 
 
 
3060 aa  127  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  28.69 
 
 
647 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  25.78 
 
 
933 aa  123  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0311  hypothetical protein  34.15 
 
 
323 aa  118  7.999999999999999e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40278  predicted protein  34.81 
 
 
934 aa  116  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0626  hypothetical protein  29.79 
 
 
467 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0659718  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  27 
 
 
1575 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  33.33 
 
 
789 aa  112  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  34.65 
 
 
754 aa  112  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50519  predicted protein  35.16 
 
 
982 aa  109  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  33.91 
 
 
774 aa  107  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_3281  predicted protein  35.36 
 
 
253 aa  107  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00042278  hitchhiker  0.000000386444 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  32.74 
 
 
762 aa  105  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2351  predicted protein  33 
 
 
279 aa  103  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0859014  normal  0.811549 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0269  putative lipoprotein  32.35 
 
 
450 aa  101  1e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.384227  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0310  hypothetical protein  34.31 
 
 
300 aa  100  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0770  putative lipoprotein  30.57 
 
 
452 aa  98.6  6e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.320317  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1170  hypothetical protein  29.01 
 
 
809 aa  98.2  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30925  predicted protein  26.92 
 
 
427 aa  96.3  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0309  hypothetical protein  33.08 
 
 
309 aa  96.3  3e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0047  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  31.72 
 
 
204 aa  94  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0262  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  36.13 
 
 
200 aa  92.4  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  29.96 
 
 
558 aa  92  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0268  putative lipoprotein  28.22 
 
 
451 aa  92  6e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0579209  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0226  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  44.33 
 
 
219 aa  90.9  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.713864  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0782  putative lipoprotein  29.32 
 
 
377 aa  90.1  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2783  lipoprotein  37.71 
 
 
180 aa  88.6  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000140646  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  48.45 
 
 
560 aa  88.2  9e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41562  predicted protein  28 
 
 
521 aa  86.7  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0981287  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0292  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  83.6  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.997759  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0293  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0302  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  81.3  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.36288  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0720  putative lipoprotein  31.58 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.298254  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  32.23 
 
 
414 aa  76.3  0.000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0170  hypothetical protein  31.34 
 
 
250 aa  76.3  0.000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1298  putative lipoprotein  39.84 
 
 
288 aa  75.9  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0289  hypothetical protein  33.09 
 
 
226 aa  72  0.00000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0704  putative lipoprotein  26.92 
 
 
399 aa  72  0.00000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0287  putative lipoprotein  29.5 
 
 
272 aa  71.2  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0276  hypothetical protein  32.59 
 
 
173 aa  68.9  0.0000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.455861  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  33.82 
 
 
1214 aa  68.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0763  hypothetical protein  47.06 
 
 
228 aa  68.6  0.0000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0622  hypothetical protein  30.82 
 
 
509 aa  68.2  0.0000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0735448  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0135  hypothetical protein  36.19 
 
 
324 aa  66.6  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0134  hypothetical protein  39.05 
 
 
257 aa  66.6  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0942  adhesion exoprotein  30.77 
 
 
2833 aa  65.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  21.55 
 
 
848 aa  64.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0737  hypothetical protein  43.37 
 
 
413 aa  63.2  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.442798  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1160  hypothetical protein  42.47 
 
 
3204 aa  61.6  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140088 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2646  lipoprotein  26.94 
 
 
275 aa  61.6  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0291  hypothetical protein  37.8 
 
 
182 aa  59.7  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0186  hypothetical protein  30.67 
 
 
913 aa  58.9  0.0000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0814  lipoprotein  44.32 
 
 
166 aa  57.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0444  hypothetical protein  40.23 
 
 
369 aa  57.4  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.640177  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0738  hypothetical protein  37.38 
 
 
446 aa  56.2  0.000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0736  hypothetical protein  37.04 
 
 
423 aa  56.2  0.000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34199  predicted protein  27.43 
 
 
321 aa  55.5  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04560  protein of unknown function, DUF285  25.75 
 
 
283 aa  55.5  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.593909  hitchhiker  0.000000409954 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0312  putative lipoprotein  30.71 
 
 
371 aa  55.5  0.000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.386247  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4487  lipoprotein  29.67 
 
 
658 aa  54.3  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0247775 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0177  hypothetical protein  37.04 
 
 
129 aa  54.3  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0305  hypothetical protein  33.88 
 
 
496 aa  53.5  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0308  hypothetical protein  35.96 
 
 
181 aa  53.5  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0288  hypothetical protein  33.04 
 
 
190 aa  53.9  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29265  predicted protein  34.95 
 
 
236 aa  53.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0242  putative lipoprotein  28.19 
 
 
762 aa  53.9  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0120138  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  28.66 
 
 
987 aa  53.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2735  surface antigen, putative  23.13 
 
 
460 aa  52.8  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000450134  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0557  hypothetical protein  40.58 
 
 
193 aa  52.8  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05064  hypothetical protein  34.58 
 
 
158 aa  52.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0941  protein of unknown function DUF285 lipoprotein  33.8 
 
 
164 aa  52.4  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.885943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  24.49 
 
 
710 aa  51.6  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2684  hemagluttinin family protein  19.42 
 
 
706 aa  51.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0735  hypothetical protein  38.89 
 
 
415 aa  50.4  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0173  hypothetical protein  42.86 
 
 
95 aa  50.4  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2308  Haemagluttinin domain protein  19.42 
 
 
744 aa  50.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0212  putative lipoprotein  32.65 
 
 
265 aa  46.2  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>