More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0944 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 805 aa  662    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 819 aa  654    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 958 aa  1066    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 925 aa  682    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 858 aa  725    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 804 aa  691    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3538  leucyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 936 aa  727    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 857 aa  640    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 802 aa  743    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 944 aa  707    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 833 aa  729    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 806 aa  692    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 805 aa  669    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 802 aa  743    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 802 aa  743    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 802 aa  743    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 936 aa  763    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 951 aa  1003    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 		 950 aa  1065    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 838 aa  723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 954 aa  1102    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2634  leucyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 969 aa  716    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 805 aa  667    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2234  leucyl-tRNA synthetase  60.65 
 
 		 982 aa  1209    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0120653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  56.45 
 
 		 952 aa  1077    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 1016 aa  959    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 949 aa  1066    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 802 aa  743    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 806 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1568  leucyl-tRNA synthetase  60.45 
 
 		 984 aa  1222    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.609969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 802 aa  743    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 1064 aa  1003    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 978 aa  1058    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 802 aa  744    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 923 aa  701    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12550  leucyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 985 aa  1075    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220072  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1254  leucyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 922 aa  719    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 802 aa  739    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 802 aa  743    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 949 aa  1024    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 949 aa  726    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 805 aa  708    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 802 aa  743    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 802 aa  745    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 969 aa  987    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 971 aa  1045    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  62.24 
 
 		 978 aa  1222    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  61.69 
 
 		 990 aa  1211    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 806 aa  647    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 921 aa  729    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 952 aa  1018    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 954 aa  686    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 835 aa  702    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 857 aa  751    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  55.95 
 
 		 934 aa  1060    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 829 aa  672    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 804 aa  674    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 808 aa  693    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 833 aa  739    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17360  leucyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 984 aa  1102    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634909  normal  0.0124443 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 840 aa  670    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  55.7 
 
 		 963 aa  1037    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  60.32 
 
 		 968 aa  1191    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  100 
 
 		 994 aa  2061    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 807 aa  659    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 971 aa  1045    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  79.2 
 
 		 987 aa  1639    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 968 aa  1057    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 854 aa  674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 805 aa  669    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 		 971 aa  1046    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 906 aa  627  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 816 aa  628  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  38.51 
 
 		 899 aa  617  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 801 aa  597  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 805 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 800 aa  592  1e-167  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 824 aa  588  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  42.99 
 
 		 879 aa  587  1e-166  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 810 aa  580  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 824 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 829 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 823 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 806 aa  568  1e-160  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 825 aa  567  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 830 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 829 aa  561  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf171  leucyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 804 aa  562  1e-158  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 817 aa  552  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 819 aa  551  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 865 aa  550  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 878 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 854 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 856 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 828 aa  546  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 		 826 aa  543  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 		 825 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 		 801 aa  543  1e-153  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7138  leucyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 828 aa  545  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.480251 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 856 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>