More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0908 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  91.77 
 
 		 401 aa  727    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 401 aa  792    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  69.83 
 
 		 399 aa  535  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  67.83 
 
 		 399 aa  528  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2170  Phosphoglycerate kinase  68.58 
 
 		 399 aa  518  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  62.75 
 
 		 398 aa  500  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2199  Phosphoglycerate kinase  65.09 
 
 		 395 aa  501  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000332645  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1942  Phosphoglycerate kinase  66.83 
 
 		 395 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.797468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  63.84 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1549  Phosphoglycerate kinase  67.57 
 
 		 405 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2531  phosphoglycerate kinase  63.09 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  62.85 
 
 		 395 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15210  phosphoglycerate kinase  61.35 
 
 		 400 aa  471  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00329101  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  60.85 
 
 		 395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  61.35 
 
 		 395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2980  Phosphoglycerate kinase  61.29 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.0361725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3009  Phosphoglycerate kinase  61.85 
 
 		 394 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0329661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5198  Phosphoglycerate kinase  61.54 
 
 		 388 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11360  phosphoglycerate kinase  58.92 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.430751  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  59.66 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  58.11 
 
 		 687 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3709  phosphoglycerate kinase  58.27 
 
 		 402 aa  434  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  58.91 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  58.15 
 
 		 407 aa  428  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15880  phosphoglycerate kinase  59.01 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00341206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  54.39 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  54.64 
 
 		 394 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  54.64 
 
 		 394 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  54.64 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  54.89 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  54.89 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  54.64 
 
 		 394 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  54.64 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2364  Phosphoglycerate kinase  58.91 
 
 		 403 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  54.64 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  54.64 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  55.56 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  54.14 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  54.64 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2930  Phosphoglycerate kinase  58.27 
 
 		 412 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  56.11 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  54.86 
 
 		 650 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  55.05 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1829  phosphoglycerate kinase  54 
 
 		 408 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2445  phosphoglycerate kinase  56.59 
 
 		 407 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.637803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  54.57 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11465  phosphoglycerate kinase  56.93 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0038039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2405  phosphoglycerate kinase  56.59 
 
 		 407 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2451  phosphoglycerate kinase  56.59 
 
 		 407 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  52.49 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.5 
 
 		 646 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  54 
 
 		 394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  54.68 
 
 		 400 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  54.68 
 
 		 400 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  54 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2801  Phosphoglycerate kinase  55.67 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000278767  hitchhiker  0.000011346 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  55.56 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2088  phosphoglycerate kinase  55.25 
 
 		 408 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.283542  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3324  phosphoglycerate kinase  55.06 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  52.53 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  55.56 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  54.8 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.78 
 
 		 655 aa  401  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  56.11 
 
 		 397 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  53.22 
 
 		 401 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  53.67 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 		 397 aa  396  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1638  phosphoglycerate kinase  56.72 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3097  phosphoglycerate kinase  55.06 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767989  normal  0.141125 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  53.5 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  52.27 
 
 		 402 aa  398  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  53.22 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  51.25 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  53.22 
 
 		 401 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  52.38 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  56.06 
 
 		 400 aa  388  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  52.51 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  53.6 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  53.35 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  52.75 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  56.46 
 
 		 400 aa  383  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  52.75 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  52.51 
 
 		 402 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  52.12 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  50.87 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  50.87 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  53.42 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  51.95 
 
 		 402 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  51.49 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  51.12 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  51.76 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  52.81 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  51.36 
 
 		 398 aa  378  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  47.38 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  50.62 
 
 		 395 aa  368  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  50.37 
 
 		 407 aa  366  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  51.76 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  51 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>