More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0714 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0714  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  100 
 
 
377 aa  764    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.669809 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1989  Von Willebrand factor type A domain containing membrane protein  70.05 
 
 
359 aa  539  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3957  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.93 
 
 
347 aa  388  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.305004 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3075  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.49 
 
 
372 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0611881  decreased coverage  0.0000000372935 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19020  MoxR-like ATPase  55.42 
 
 
377 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2449  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.57 
 
 
349 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.281156  decreased coverage  0.00339489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.11 
 
 
335 aa  350  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35700  MoxR-like ATPase  56.13 
 
 
332 aa  343  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2374  ATPase  50 
 
 
363 aa  341  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0039  ATPase  50.76 
 
 
333 aa  340  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0879  ATPase  50.91 
 
 
334 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.714074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5165  ATPase  49.06 
 
 
333 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5254  ATPase  49.06 
 
 
333 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613328  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5546  ATPase  49.06 
 
 
333 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.15 
 
 
350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.5 
 
 
329 aa  292  6e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.34 
 
 
353 aa  292  8e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  44.31 
 
 
331 aa  290  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  44.31 
 
 
331 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  43.11 
 
 
340 aa  288  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  42.2 
 
 
334 aa  287  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  41.42 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  46.75 
 
 
328 aa  286  4e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  44.62 
 
 
331 aa  286  5.999999999999999e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.1 
 
 
432 aa  286  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.14 
 
 
333 aa  285  7e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  46.95 
 
 
327 aa  285  8e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  45.45 
 
 
345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.15 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  45.96 
 
 
320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.04 
 
 
329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.78 
 
 
350 aa  282  6.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  45.45 
 
 
337 aa  282  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  46.43 
 
 
337 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  44.41 
 
 
339 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  44.38 
 
 
316 aa  281  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  45.16 
 
 
332 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.64 
 
 
342 aa  280  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.6 
 
 
332 aa  279  6e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  43.45 
 
 
320 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  43.81 
 
 
371 aa  278  8e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.78 
 
 
346 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  45.22 
 
 
328 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  42.99 
 
 
390 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  42.99 
 
 
390 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  42.99 
 
 
390 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  47.28 
 
 
348 aa  276  6e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  43.14 
 
 
339 aa  275  7e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.88 
 
 
331 aa  275  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  42.99 
 
 
335 aa  275  9e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  43.53 
 
 
318 aa  275  9e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  45.66 
 
 
318 aa  275  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.73 
 
 
332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.18 
 
 
327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.58 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.13 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.86 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  46.65 
 
 
369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  40.76 
 
 
315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.83 
 
 
360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  44.9 
 
 
318 aa  273  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  41.93 
 
 
385 aa  272  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  42.24 
 
 
386 aa  272  7e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  42.9 
 
 
323 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  44.41 
 
 
324 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  45.74 
 
 
324 aa  271  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  43.49 
 
 
370 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  45.13 
 
 
345 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  42.72 
 
 
330 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  41.77 
 
 
325 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  42.02 
 
 
330 aa  271  2e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  45.02 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  44.81 
 
 
345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.35 
 
 
362 aa  270  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  41.88 
 
 
344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.54 
 
 
336 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.55 
 
 
325 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  44.59 
 
 
318 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  44.9 
 
 
318 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.16 
 
 
332 aa  268  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  43.77 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.24 
 
 
325 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  44.14 
 
 
347 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  44.13 
 
 
369 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  41.74 
 
 
335 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  44.75 
 
 
318 aa  266  4e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  44.34 
 
 
318 aa  266  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  41.53 
 
 
349 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  42.72 
 
 
332 aa  265  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.84 
 
 
332 aa  265  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  42.99 
 
 
377 aa  265  8e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  42.99 
 
 
318 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  43.52 
 
 
333 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  44.59 
 
 
335 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  41.88 
 
 
339 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  43.99 
 
 
332 aa  264  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  40.54 
 
 
326 aa  264  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  41.45 
 
 
335 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  43.85 
 
 
316 aa  263  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.94 
 
 
326 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>