99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0694 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  100 
 
 		 393 aa  788    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  63.7 
 
 		 408 aa  496  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  54.76 
 
 		 386 aa  431  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  55.27 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  53 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  51.96 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  50.89 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  49.12 
 
 		 414 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  48.95 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  48.08 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  45.76 
 
 		 389 aa  335  5.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 326 aa  277  3e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 395 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 425 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 407 aa  152  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  24.56 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  23.58 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  23.58 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  23.59 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  25.97 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  21.82 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  23.3 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  26.83 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  21.68 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  26.29 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 422 aa  53.5  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  24.15 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  22.74 
 
 		 529 aa  52.8  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  22.77 
 
 		 385 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3382  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  20.86 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0010  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260757 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  22.03 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  22.55 
 
 		 507 aa  49.7  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  21.22 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  22.45 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07240  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17270)  24.92 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07119  conserved hypothetical protein  34.21 
 
 		 619 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.740626 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  21.69 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 382 aa  47.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  22.86 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  22.18 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  29.05 
 
 		 383 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  26.12 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  25.22 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 398 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  20.94 
 
 		 395 aa  46.6  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  21.56 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  21.97 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  25 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1573  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  21.81 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  21.41 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  22.78 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  21.6 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  22.32 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5931  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0299912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  21.35 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  24.32 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  23.96 
 
 		 462 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 427 aa  43.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0742  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 474 aa  43.1  0.008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368035  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 369 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  27.27 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  21.68 
 
 		 401 aa  43.1  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>