More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0549 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  100 
 
 		 310 aa  627  1e-179  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  66.13 
 
 		 310 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  64.17 
 
 		 309 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  63.84 
 
 		 310 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  62.21 
 
 		 309 aa  383  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  58.06 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  60.91 
 
 		 309 aa  371  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  61.31 
 
 		 309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  57.93 
 
 		 317 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  59.55 
 
 		 317 aa  353  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  59.8 
 
 		 308 aa  350  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  56.77 
 
 		 308 aa  348  8e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  59.22 
 
 		 327 aa  346  3e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  55.52 
 
 		 304 aa  344  1e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  58.9 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  57.74 
 
 		 311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  57.47 
 
 		 316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  58.77 
 
 		 331 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  55.99 
 
 		 317 aa  338  5e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  54.4 
 
 		 318 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  57.14 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  56.31 
 
 		 309 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  54.72 
 
 		 312 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  57.38 
 
 		 311 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  56.13 
 
 		 309 aa  335  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  55.41 
 
 		 312 aa  335  7e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  56.96 
 
 		 311 aa  333  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  55.81 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  54.19 
 
 		 309 aa  332  3e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  56.63 
 
 		 308 aa  331  8e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  56.27 
 
 		 309 aa  330  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  54.64 
 
 		 310 aa  328  6e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  54.84 
 
 		 308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  56.96 
 
 		 320 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  53.42 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  56.63 
 
 		 313 aa  328  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  53.57 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  55.56 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  54.19 
 
 		 311 aa  326  2.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  53.27 
 
 		 304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  57.93 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  54.13 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  54.13 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  56.77 
 
 		 320 aa  325  5e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  57.1 
 
 		 309 aa  325  8.000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  54.55 
 
 		 322 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  55.34 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  54.52 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  52.44 
 
 		 307 aa  323  2e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  57.28 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  57.33 
 
 		 322 aa  323  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  54.69 
 
 		 320 aa  323  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  52.9 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  54.87 
 
 		 320 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  57.1 
 
 		 309 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  53.77 
 
 		 309 aa  322  6e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  51.94 
 
 		 311 aa  322  7e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  51.13 
 
 		 320 aa  321  9.000000000000001e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  55.05 
 
 		 328 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  54.69 
 
 		 319 aa  321  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  53.25 
 
 		 309 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  52.77 
 
 		 327 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  50.97 
 
 		 311 aa  319  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  54.72 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  55.02 
 
 		 320 aa  318  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  55.05 
 
 		 310 aa  318  7e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  55.52 
 
 		 320 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  54.9 
 
 		 308 aa  318  9e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  52.58 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  55.19 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  54.9 
 
 		 310 aa  316  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  55.88 
 
 		 305 aa  316  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  50.65 
 
 		 320 aa  316  4e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  53.25 
 
 		 309 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  51.14 
 
 		 320 aa  315  5e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  52.75 
 
 		 320 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  50.49 
 
 		 307 aa  315  7e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  55.37 
 
 		 306 aa  315  7e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  53.25 
 
 		 309 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  55.16 
 
 		 309 aa  315  9e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  51.14 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  52.6 
 
 		 309 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  53.4 
 
 		 308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  56.03 
 
 		 332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  56.49 
 
 		 321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  50.33 
 
 		 304 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  57.33 
 
 		 332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  53.44 
 
 		 309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  51.79 
 
 		 339 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  55.19 
 
 		 320 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  53.14 
 
 		 317 aa  311  9e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  53.87 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4360  cysteine synthase  55.7 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  49.02 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  51.79 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  53.25 
 
 		 308 aa  309  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  54.69 
 
 		 323 aa  309  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  56.07 
 
 		 310 aa  308  5e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  52.29 
 
 		 309 aa  308  6.999999999999999e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  53.9 
 
 		 314 aa  308  8e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>