More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0462 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  100 
 
 		 300 aa  627  1e-178  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  72.45 
 
 		 298 aa  460  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  41.7 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  39.93 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  34.01 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  36.36 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  34.28 
 
 		 303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  34.9 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  32.76 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  35.97 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  33 
 
 		 324 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  31.99 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  31.74 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  34.15 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  31.14 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  32.09 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  29.77 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  31.69 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  29.17 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  30.99 
 
 		 296 aa  122  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  31.74 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  30.96 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  31.47 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  30.77 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  26.9 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  26.9 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.03 
 
 		 323 aa  89.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  27.94 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  25.24 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  25.47 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  25.97 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  30.77 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  26.11 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.12 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  28.35 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  26.16 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  25.56 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  25.62 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  25.16 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  24.69 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  26.71 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  27.3 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  26.2 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  27.18 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  26.2 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  29.29 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  28.48 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  29.65 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  24.44 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  26.28 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  26.57 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  27.04 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  28.06 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  25.81 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  25.96 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  25.96 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  25.96 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  26.14 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  30.26 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.24 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  25.88 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  24.84 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  26.59 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  24.92 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  24.84 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  25.09 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  27.76 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  27.5 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  24.06 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  29.04 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  25.56 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  23.6 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  24.1 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  26.27 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  25.53 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  24.06 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  27.45 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  24.33 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  25.4 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  25.34 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  26.72 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  28.01 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  24.92 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  27.56 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  24.45 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  24.84 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  26.89 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  25.39 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  23.6 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  25.39 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  28.77 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  25.35 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  25.87 
 
 		 364 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  25.39 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  24.53 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  24.18 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  27.49 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>