28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0432 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0432  Abi-like protein  100 
 
 		 360 aa  747    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4658  Abi family protein  35.95 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1138  abortive infection bacteriophage resistance protein  30.33 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000644215  hitchhiker  0.00199936 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4994  Abi family protein  25.32 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1061  phage AbiD protein  24.89 
 
 		 304 aa  87.4  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3524  Abi family protein  25.41 
 
 		 310 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0357  Abi-like  26.36 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.949263  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0031  Abi-like  24.81 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0049  hypothetical protein  26.23 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3671  hypothetical protein  26.52 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1806  abortive infection bacteriophage resistance protein  24.19 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2514  Abi-like protein  25.74 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2861  Abi family protein  23.11 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1154  Abi family protein  24.07 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.554725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34500  abortive infection bacteriophage resistance protein  24.37 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02065  abortive infection bacteriophage resistance protein  23.08 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5272  Abi family protein  23.01 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00172  Abi-like protein  24.14 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1019  Abi family protein  23.36 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4012  Abi family protein  24.27 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.628859  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4682  Abi family protein  26.74 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0400  Abi-like protein  27.84 
 
 		 202 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0426  Abi-like protein  33.33 
 
 		 118 aa  57.4  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4054  Abi family protein  25.59 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3652  Abi family protein  20.87 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1698  abortive infection bacteriophage resistance protein  26.27 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00541232  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0048  abortive infection bacteriophage resistance protein  23.97 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000156984  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1229  Abi family protein  24.42 
 
 		 289 aa  43.9  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>