106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0427 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  100 
 
 		 365 aa  757    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  55.91 
 
 		 381 aa  438  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  66.67 
 
 		 339 aa  437  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  55.81 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  48.67 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  45.45 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  54.9 
 
 		 377 aa  186  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  38.77 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  36.18 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  38.58 
 
 		 291 aa  179  8e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  38.08 
 
 		 293 aa  169  7e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  39.68 
 
 		 324 aa  169  9e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  39.92 
 
 		 266 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  38.22 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  40.97 
 
 		 272 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  36.03 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  40.97 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  34.29 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  38.24 
 
 		 266 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  44.13 
 
 		 294 aa  159  7e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  34.2 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  40.79 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  41.82 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  38.74 
 
 		 273 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  40 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  38.84 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  34.25 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  40.09 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  39.52 
 
 		 273 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  36.16 
 
 		 269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  32.45 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  39.48 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  40.09 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  36.32 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1522  sortase family protein  38.67 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.301282  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0807  sortase (surface protein transpeptidase)  50 
 
 		 249 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.759239  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  32.49 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  50 
 
 		 189 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1484  sortase family protein  30.48 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  28.1 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  26.2 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  25.67 
 
 		 210 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  30.43 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  33.04 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  31.03 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  25.89 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  31.54 
 
 		 268 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  29.85 
 
 		 197 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.6 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.13 
 
 		 210 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.13 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.6 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.33 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.6 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.6 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.6 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  24.6 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  24.6 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  29.05 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.14 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.67 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.57 
 
 		 198 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.57 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.57 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  26.57 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.57 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  34.45 
 
 		 217 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  28.49 
 
 		 225 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2551  sortase  30.08 
 
 		 206 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2603  sortase  30.08 
 
 		 206 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  27.05 
 
 		 247 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  30.37 
 
 		 267 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  30.71 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  26.72 
 
 		 187 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  28.28 
 
 		 238 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  32.17 
 
 		 205 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  29.05 
 
 		 192 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  28.95 
 
 		 229 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  30.08 
 
 		 220 aa  53.1  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  32.81 
 
 		 235 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0825  sortase (surface protein transpeptidase)  27.61 
 
 		 229 aa  52.8  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  32 
 
 		 298 aa  52.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  25.86 
 
 		 187 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  32.43 
 
 		 195 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  31.75 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  30.88 
 
 		 244 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  29.85 
 
 		 350 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0073  peptidase C60 sortase A and B  31.82 
 
 		 320 aa  50.4  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.787653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  37.88 
 
 		 215 aa  50.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  35.23 
 
 		 218 aa  49.7  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  32.81 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  27.97 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  30.97 
 
 		 223 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  29.63 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  28.78 
 
 		 249 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  29.01 
 
 		 236 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  23.08 
 
 		 206 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  30.65 
 
 		 238 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2089  sortase  21.5 
 
 		 203 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  29.46 
 
 		 233 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>