More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0343 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4714  glucose-6-phosphate isomerase  58.78 
 
 		 554 aa  670    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1311  Glucose-6-phosphate isomerase  65.57 
 
 		 560 aa  746    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15279  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11040  glucose-6-phosphate isomerase  64.17 
 
 		 564 aa  736    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0493698  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  63.28 
 
 		 570 aa  739    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1025  glucose-6-phosphate isomerase  89.56 
 
 		 566 aa  1026    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1463  glucose-6-phosphate isomerase  64.58 
 
 		 561 aa  752    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05060  glucose-6-phosphate isomerase  56.91 
 
 		 552 aa  637    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4334  glucose-6-phosphate isomerase  58.6 
 
 		 554 aa  670    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1318  glucose-6-phosphate isomerase  73.88 
 
 		 568 aa  852    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.321309 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10963  glucose-6-phosphate isomerase  56.11 
 
 		 553 aa  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0183  Glucose-6-phosphate isomerase  64.16 
 
 		 571 aa  748    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0343  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 564 aa  1164    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  57.53 
 
 		 549 aa  649    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4420  glucose-6-phosphate isomerase  58.6 
 
 		 554 aa  670    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  57.71 
 
 		 553 aa  658    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  56.78 
 
 		 543 aa  632  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0370  Glucose-6-phosphate isomerase  56.99 
 
 		 561 aa  634  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1334  Glucose-6-phosphate isomerase  55.81 
 
 		 565 aa  612  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.994679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  55.52 
 
 		 543 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3338  Glucose-6-phosphate isomerase  55.64 
 
 		 554 aa  609  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  54.45 
 
 		 543 aa  608  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  53.12 
 
 		 569 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  54.11 
 
 		 649 aa  602  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  53.64 
 
 		 548 aa  601  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  53.15 
 
 		 546 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  54.82 
 
 		 556 aa  596  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7286  glucose-6-phosphate isomerase  55.72 
 
 		 570 aa  596  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813116  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  53.33 
 
 		 546 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  52.25 
 
 		 550 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0469  glucose-6-phosphate isomerase  53.55 
 
 		 546 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  52.78 
 
 		 547 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7561  glucose-6-phosphate isomerase  54.71 
 
 		 545 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  51.06 
 
 		 549 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  52.42 
 
 		 567 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  50.79 
 
 		 549 aa  558  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  50.89 
 
 		 548 aa  556  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  51.97 
 
 		 548 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  50.71 
 
 		 552 aa  552  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  50.72 
 
 		 562 aa  553  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  51.33 
 
 		 559 aa  553  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 		 548 aa  548  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 539 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  50.88 
 
 		 548 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 539 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  50.88 
 
 		 548 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  50.88 
 
 		 548 aa  548  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  50.35 
 
 		 549 aa  543  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  50.89 
 
 		 550 aa  544  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 548 aa  538  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  48.66 
 
 		 546 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  50.35 
 
 		 549 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  51.05 
 
 		 550 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  50.53 
 
 		 550 aa  539  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  50.35 
 
 		 549 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  50.88 
 
 		 552 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  49.38 
 
 		 550 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  50.35 
 
 		 549 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  50.35 
 
 		 549 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  50.35 
 
 		 549 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 		 549 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 		 549 aa  537  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 		 549 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  50.18 
 
 		 549 aa  535  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  50.88 
 
 		 550 aa  537  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  50.35 
 
 		 548 aa  538  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 		 549 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  49.65 
 
 		 549 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  49.65 
 
 		 549 aa  534  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  49.01 
 
 		 549 aa  531  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  49.65 
 
 		 549 aa  534  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  49.65 
 
 		 549 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  50.56 
 
 		 531 aa  534  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  49.65 
 
 		 549 aa  534  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  49.65 
 
 		 549 aa  534  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  49.37 
 
 		 549 aa  529  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 		 539 aa  529  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  49.37 
 
 		 549 aa  529  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 550 aa  531  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  50.54 
 
 		 547 aa  531  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  48.94 
 
 		 549 aa  527  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  48.15 
 
 		 554 aa  525  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  48.5 
 
 		 549 aa  525  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  49.03 
 
 		 556 aa  524  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 549 aa  525  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  49.3 
 
 		 550 aa  518  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  49.55 
 
 		 541 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  48.94 
 
 		 550 aa  514  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84923  phosphoglucoisomerase  48.92 
 
 		 553 aa  509  1e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.154814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  47.21 
 
 		 548 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  46.74 
 
 		 553 aa  510  1e-143  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  46.9 
 
 		 545 aa  509  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  48.3 
 
 		 550 aa  508  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  48.29 
 
 		 560 aa  505  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  51.4 
 
 		 547 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17650  glucose-6-phosphate isomerase  46.02 
 
 		 554 aa  505  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0697549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  46.03 
 
 		 554 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  45.68 
 
 		 554 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  49.34 
 
 		 541 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5449  glucose-6-phosphate isomerase  45.68 
 
 		 554 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  47.29 
 
 		 545 aa  500  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>