234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0249 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0249  uncharacterized protein, YigZ family  100 
 
 		 222 aa  463  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1690  hypothetical protein  51 
 
 		 213 aa  192  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  36.32 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  40.22 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  34.85 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  36.04 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  35.96 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  37.23 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  38.46 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  36.81 
 
 		 190 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  38.1 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  37.82 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  118  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  118  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  118  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  37.95 
 
 		 197 aa  118  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  36.52 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  34.81 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  36.87 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  34.17 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  35.39 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  34.12 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  37.89 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  32.51 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  32.63 
 
 		 222 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  37.27 
 
 		 195 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  37.27 
 
 		 195 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  37.27 
 
 		 195 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  33.16 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  34.67 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  31.18 
 
 		 199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  32.63 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  33.86 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  38.5 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  36.09 
 
 		 194 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  37.89 
 
 		 195 aa  111  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  35.29 
 
 		 204 aa  111  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  31.16 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  34.05 
 
 		 290 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  34.27 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  34.18 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  35.71 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  34.48 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  34.72 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  36.02 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  36.46 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  35.36 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  32.49 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  42.36 
 
 		 208 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  35.36 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  34.78 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  32.63 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  32.96 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1712  protein of unknown function UPF0029  36.31 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3065  protein of unknown function UPF0029  34.47 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.4759e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  37.65 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  37.65 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  32.26 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  33.93 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  37.65 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  37.65 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  35.87 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  29.74 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  34.71 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  31.25 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  32.47 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  34.44 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  32.76 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  32.76 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  33.86 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  34.24 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  32.07 
 
 		 203 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  38.51 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  32.2 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  36.25 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2997  protein of unknown function UPF0029  38.18 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  33.12 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  30.39 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  40.85 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  30.77 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  32.76 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  34.24 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  35 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  38.69 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  34.38 
 
 		 198 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  36.02 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  38.69 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  38.69 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  32.99 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  37.31 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  34.34 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  38.69 
 
 		 205 aa  99  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000121216  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  38.69 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000068448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  38.69 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  38.69 
 
 		 205 aa  99  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  38.69 
 
 		 205 aa  99  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  0.0000831038 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1667  hypothetical protein  32 
 
 		 186 aa  97.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.494886  normal  0.674111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  32.72 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  30.65 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>