More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0234 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  100 
 
 		 97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  94.85 
 
 		 97 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  72.16 
 
 		 97 aa  150  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  73.96 
 
 		 97 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  72.16 
 
 		 97 aa  146  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  70.83 
 
 		 97 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  69.79 
 
 		 98 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  69.07 
 
 		 97 aa  144  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 		 97 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  68.75 
 
 		 98 aa  143  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  69.15 
 
 		 102 aa  141  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  71.28 
 
 		 102 aa  140  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  68.09 
 
 		 104 aa  141  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 98 aa  140  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 		 98 aa  139  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  70.97 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  67.71 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  67.71 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  67.71 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 102 aa  135  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  64.58 
 
 		 99 aa  134  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 101 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  67.74 
 
 		 99 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  68.09 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  67.37 
 
 		 103 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 100 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 101 aa  130  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  61.46 
 
 		 99 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 98 aa  128  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  63.44 
 
 		 96 aa  127  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2595  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 97 aa  126  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2887  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 97 aa  126  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0300428  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  65.59 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  62.5 
 
 		 98 aa  122  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  60.22 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 		 95 aa  120  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 96 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 96 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 96 aa  116  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 95 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 94 aa  115  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  56.7 
 
 		 97 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  51.04 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  114  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  57.73 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2314  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  59.09 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 96 aa  114  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 96 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 98 aa  113  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 96 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 96 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 98 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  54.35 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>