More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0212 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  176  7e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  91.01 
 
 		 89 aa  164  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  147  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  141  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  135  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  74.16 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  76.47 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  133  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  73.86 
 
 		 90 aa  130  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  69.66 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  75.58 
 
 		 88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  70.93 
 
 		 88 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  68.97 
 
 		 88 aa  123  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  66.29 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 88 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  117  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1734  ribosomal protein S15  79.78 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.439379  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  64.04 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2163  ribosomal protein S15  79.78 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0163  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  66.28 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2082  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151989 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2145  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0715558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>