19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0098 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0098  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.15256 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1209  hypothetical protein  56.77 
 
 		 209 aa  221  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2425  orotate phosphoribosyltransferase  38 
 
 		 191 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.205434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35310  orotate phosphoribosyltransferase  37.86 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.238269  normal  0.306388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3147  orotate phosphoribosyltransferase  36.89 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 		 177 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  29.92 
 
 		 195 aa  52.4  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0652  orotate phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2123  orotate phosphoribosyltransferase  34.41 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 		 188 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 178 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0125  orotate phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0394  Orotate phosphoribosyltransferase  36.89 
 
 		 178 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0130  orotate phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 		 179 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000251206 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25780  orotate phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 		 187 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 184 aa  42.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>