242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0097 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  100 
 
 		 446 aa  900    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  66.44 
 
 		 467 aa  556  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  44.61 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  46.37 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  42.9 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  41.77 
 
 		 486 aa  253  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  41.77 
 
 		 512 aa  253  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  46.63 
 
 		 428 aa  253  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  41.89 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  44.25 
 
 		 501 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  41.18 
 
 		 525 aa  249  8e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  40.99 
 
 		 364 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  43.52 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  38.75 
 
 		 503 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  39.3 
 
 		 378 aa  240  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  42.71 
 
 		 434 aa  239  8e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  38.07 
 
 		 531 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  41.06 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  42.3 
 
 		 403 aa  237  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  39.88 
 
 		 494 aa  236  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  45.43 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  39.83 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  43.62 
 
 		 459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  38.18 
 
 		 545 aa  233  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  45.02 
 
 		 399 aa  233  7.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  39.93 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  43.58 
 
 		 523 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  41.08 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  41.08 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  43.2 
 
 		 366 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  41.1 
 
 		 554 aa  229  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  41.32 
 
 		 493 aa  227  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  40.07 
 
 		 443 aa  226  6e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  38.27 
 
 		 462 aa  226  6e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  42.86 
 
 		 443 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  39.63 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  43.21 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  42.91 
 
 		 451 aa  221  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  40.83 
 
 		 387 aa  219  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  40.47 
 
 		 504 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  41.96 
 
 		 374 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  34.81 
 
 		 473 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  41.84 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  40.07 
 
 		 391 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  39.19 
 
 		 442 aa  209  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  37.78 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  32.57 
 
 		 431 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  38.75 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  34.35 
 
 		 425 aa  193  5e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  35.35 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  34.6 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  29.84 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  30.53 
 
 		 492 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  31.1 
 
 		 492 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  32.53 
 
 		 495 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  32.18 
 
 		 495 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  31.19 
 
 		 495 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  31.83 
 
 		 495 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  29.86 
 
 		 532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  34.6 
 
 		 491 aa  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  29.58 
 
 		 515 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  31.97 
 
 		 506 aa  149  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  29.89 
 
 		 531 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01951  RmuC  30.52 
 
 		 429 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1614  hypothetical protein  30.47 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0228591  normal  0.73372 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  33.46 
 
 		 518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  28.84 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  29.81 
 
 		 498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  31.68 
 
 		 424 aa  146  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  32.96 
 
 		 420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2433  hypothetical protein  30.28 
 
 		 513 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  32.37 
 
 		 510 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  29.43 
 
 		 513 aa  146  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0270  RmuC domain-containing protein  29.01 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3642  RmuC domain-containing protein  29.01 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3946  hypothetical protein  29.01 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.737654  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  30.42 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  28.45 
 
 		 522 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00561  hypothetical protein  32.01 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  30.55 
 
 		 548 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  27.68 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  27.68 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  27.68 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  27.68 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  27.68 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  27.68 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  27.68 
 
 		 475 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  29.45 
 
 		 457 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  27.68 
 
 		 475 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  28 
 
 		 485 aa  143  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  29.5 
 
 		 475 aa  143  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  28.97 
 
 		 448 aa  143  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  30.32 
 
 		 500 aa  143  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  30.24 
 
 		 453 aa  142  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0018  RmuC domain-containing protein  28.73 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  29.24 
 
 		 476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  29.24 
 
 		 476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  29.24 
 
 		 476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  29.24 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  29.24 
 
 		 476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>