78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0063 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  100 
 
 		 460 aa  943    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  54.11 
 
 		 479 aa  355  1e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  29 
 
 		 451 aa  180  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  26.95 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  53.64 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  51.38 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  52.88 
 
 		 231 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  49.14 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  31.78 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  55.68 
 
 		 359 aa  110  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  54.02 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  51.04 
 
 		 216 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  50.52 
 
 		 209 aa  103  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  43.7 
 
 		 196 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  51.69 
 
 		 249 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  53.49 
 
 		 239 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  60.53 
 
 		 272 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  55.95 
 
 		 164 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  47.32 
 
 		 238 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  56.47 
 
 		 234 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  50.57 
 
 		 222 aa  96.7  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  56.16 
 
 		 232 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  56.16 
 
 		 227 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  24.35 
 
 		 375 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  45 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  43.7 
 
 		 145 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  27.06 
 
 		 479 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  42 
 
 		 243 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  25.1 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  60.32 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  53.42 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  49.41 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  43.53 
 
 		 258 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  26.48 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  52.86 
 
 		 348 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  27.24 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  48.57 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  24.54 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  26.88 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  43.59 
 
 		 328 aa  72.8  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  24.34 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  26.74 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  45.05 
 
 		 282 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  23.78 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  27.27 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  42.03 
 
 		 331 aa  66.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  25.08 
 
 		 547 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  23.83 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  24.73 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  24.73 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  34.82 
 
 		 1995 aa  60.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  25.95 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  20.92 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  25.35 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  23.53 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  23.53 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  23.53 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  24.32 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  22.59 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  23.84 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  27.54 
 
 		 343 aa  53.5  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  26.41 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  23.04 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  22.1 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  24.51 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  20.56 
 
 		 347 aa  50.1  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  23.31 
 
 		 362 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  31.91 
 
 		 520 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1137  Peptidase M23  22.62 
 
 		 468 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  22.3 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  34.43 
 
 		 518 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  20.76 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  29.5 
 
 		 295 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0070  3D domain-containing protein  25.19 
 
 		 309 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  19.79 
 
 		 340 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  32 
 
 		 482 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  30.77 
 
 		 446 aa  43.5  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  25.34 
 
 		 356 aa  43.5  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>