More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0052 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  100 
 
 		 323 aa  665    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  70.19 
 
 		 323 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.04 
 
 		 410 aa  318  7.999999999999999e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2552  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.17 
 
 		 312 aa  314  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000741999  normal  0.352702 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  54.78 
 
 		 315 aa  312  4.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4218  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.48 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.6 
 
 		 339 aa  302  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38000  chromosome segregation ATPase  52.92 
 
 		 305 aa  301  7.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.18 
 
 		 301 aa  301  8.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.1 
 
 		 355 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.56 
 
 		 346 aa  299  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  54.14 
 
 		 308 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.89 
 
 		 392 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  55.88 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.17 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3720  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.6 
 
 		 416 aa  296  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000821515  hitchhiker  0.000233932 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31920  chromosome segregation ATPase  52.13 
 
 		 293 aa  295  7e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.47 
 
 		 433 aa  294  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  54.92 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  55.68 
 
 		 361 aa  292  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.09 
 
 		 437 aa  291  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  54.92 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.33 
 
 		 315 aa  290  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.96 
 
 		 314 aa  289  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.47 
 
 		 303 aa  289  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4166  chromosome segregation ATPase  51.72 
 
 		 333 aa  288  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  51.7 
 
 		 345 aa  286  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  50.7 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.71 
 
 		 462 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  50.7 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.18 
 
 		 358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  50.7 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.83 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2155  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.75 
 
 		 312 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.426789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.69 
 
 		 470 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4237  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.96 
 
 		 304 aa  276  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.83 
 
 		 318 aa  275  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  52.09 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.4 
 
 		 253 aa  255  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.18 
 
 		 253 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  47.08 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.42 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.84 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  49.42 
 
 		 260 aa  249  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 254 aa  245  6e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  49.2 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  49.8 
 
 		 249 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  50.79 
 
 		 253 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  48.06 
 
 		 258 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.27 
 
 		 254 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.66 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  47.88 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  46.54 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.15 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.83 
 
 		 255 aa  238  8e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.89 
 
 		 257 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  47.47 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.83 
 
 		 252 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  46.25 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  46.25 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.49 
 
 		 270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.83 
 
 		 253 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  46.67 
 
 		 253 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.09 
 
 		 268 aa  232  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  46.83 
 
 		 270 aa  232  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.67 
 
 		 257 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  46.46 
 
 		 257 aa  232  7.000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.05 
 
 		 253 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.25 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.1 
 
 		 257 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.67 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.02 
 
 		 253 aa  230  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  45.04 
 
 		 264 aa  228  7e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  46.25 
 
 		 259 aa  228  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.04 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  47.62 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  47.62 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  47.62 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.09 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  47.62 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  47.62 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  47.62 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  47.62 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.19 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  47.43 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  47.62 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.75 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.36 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.21 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  45.06 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  47.22 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  45.74 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.88 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  43.68 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.59 
 
 		 265 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  45 
 
 		 265 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.51 
 
 		 273 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  43.85 
 
 		 265 aa  225  7e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.64 
 
 		 253 aa  225  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  43.85 
 
 		 265 aa  225  7e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>