More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0049 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  100 
 
 		 337 aa  697    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  61.75 
 
 		 335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  34.78 
 
 		 314 aa  208  9e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  35.15 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  35.13 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  34.16 
 
 		 365 aa  196  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.24 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  33.75 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  32.93 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  33.83 
 
 		 324 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.84 
 
 		 363 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  33.45 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  33.53 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  34.15 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  29.63 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  31.2 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  30.89 
 
 		 266 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  30.4 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.14 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  29.96 
 
 		 338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  29.02 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  27.05 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  29.37 
 
 		 461 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  27.46 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  27.24 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  29.84 
 
 		 462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  27.21 
 
 		 385 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  27.48 
 
 		 351 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  27.27 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  29.46 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  26.83 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  28.51 
 
 		 346 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.72 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  25.71 
 
 		 341 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  26.81 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  23.66 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.09 
 
 		 575 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.25 
 
 		 518 aa  98.2  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  28.15 
 
 		 547 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  24.66 
 
 		 278 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  26.56 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.76 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  28.78 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  27.35 
 
 		 246 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.9 
 
 		 374 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.33 
 
 		 249 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.06 
 
 		 517 aa  94  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  30 
 
 		 553 aa  93.2  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  27.05 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.77 
 
 		 544 aa  92.8  6e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.41 
 
 		 584 aa  92.8  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  25.81 
 
 		 553 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4793  protein translocase subunit yidC  28.23 
 
 		 565 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  27.34 
 
 		 539 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.32 
 
 		 609 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  26.61 
 
 		 570 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.37 
 
 		 531 aa  91.7  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.72 
 
 		 552 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.34 
 
 		 557 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.69 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.72 
 
 		 552 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.69 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.32 
 
 		 577 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  28.26 
 
 		 252 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.69 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  24.71 
 
 		 552 aa  90.5  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.78 
 
 		 560 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.78 
 
 		 560 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.78 
 
 		 560 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.95 
 
 		 560 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.78 
 
 		 560 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.34 
 
 		 578 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5012  60 kDa inner membrane insertion protein  27.82 
 
 		 567 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3941  60 kDa inner membrane insertion protein  29.37 
 
 		 233 aa  90.1  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000468368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.2 
 
 		 554 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0504  preprotein translocase subunit  33.81 
 
 		 198 aa  89.7  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.2 
 
 		 554 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  26.29 
 
 		 569 aa  89.7  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.4 
 
 		 600 aa  89.4  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43657  predicted protein  25.34 
 
 		 425 aa  89.7  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  26.56 
 
 		 562 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.56 
 
 		 563 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.1 
 
 		 411 aa  89.4  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.15 
 
 		 532 aa  89  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.31 
 
 		 626 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.95 
 
 		 578 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  28 
 
 		 600 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6897  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  27.14 
 
 		 672 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.04 
 
 		 555 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  26.38 
 
 		 569 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  26.77 
 
 		 531 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.61 
 
 		 555 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  26.39 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  29.49 
 
 		 514 aa  87.4  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4140  protein translocase subunit yidC  25.98 
 
 		 570 aa  87.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.555817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.31 
 
 		 555 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.17 
 
 		 581 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.69 
 
 		 608 aa  87  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4242  60 kDa inner membrane insertion protein  25.4 
 
 		 571 aa  86.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00149519  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  24.71 
 
 		 551 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>