37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0039 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0039  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  435  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1430  hypothetical protein  68.97 
 
 		 188 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0008  putative FHA domain containing protein  39.83 
 
 		 331 aa  102  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00080  hypothetical protein  32.27 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00070  hypothetical protein  39.61 
 
 		 166 aa  102  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0008  putative integral membrane protein  46.28 
 
 		 128 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000831576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0008  hypothetical protein  44.07 
 
 		 171 aa  101  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00852528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0008  hypothetical protein  34.04 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0008  hypothetical protein  42.62 
 
 		 178 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.576466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0008  hypothetical protein  34.44 
 
 		 305 aa  86.3  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0008  hypothetical protein  38.98 
 
 		 135 aa  84.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0008  hypothetical protein  31.84 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0008  hypothetical protein  42.42 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.327365  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00080  hypothetical protein  37.17 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0008  hypothetical protein  32.26 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0007  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00120  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0008  hypothetical protein  31.01 
 
 		 645 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0008  hypothetical protein  25.68 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0746422 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0016  hypothetical protein  25.68 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403515  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0008  hypothetical protein  25.68 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0009  hypothetical protein  31.71 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0008  hypothetical protein  28.57 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.252458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0008  hypothetical protein  34.72 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0009  hypothetical protein  25.98 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0008  hypothetical protein  31.9 
 
 		 301 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0820  hypothetical protein  26.94 
 
 		 314 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12406  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10007  hypothetical protein  32.76 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0010  hypothetical protein  35.25 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.455486  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0012  hypothetical protein  30.89 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.984121  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0009  hypothetical protein  34.45 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625071  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0007  hypothetical protein  34.78 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0008  hypothetical protein  34.82 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00080  hypothetical protein  34.82 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.852308  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0011  hypothetical protein  24.14 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.249948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>