171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0037 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0037  PAP2 family protein  100 
 
 
245 aa  488  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.43 
 
 
182 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.83 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0231  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.79 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.21 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0824  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.71 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  28.02 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2461  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.93 
 
 
254 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.38 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0615  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.94 
 
 
233 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6892  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.86 
 
 
251 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1039  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.83 
 
 
183 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1706  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.67 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2162  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  25.83 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.9 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2814  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.41 
 
 
238 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000029245  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0119  PA-phosphatase related phosphoesterase  28.57 
 
 
256 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00406131  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.36 
 
 
179 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5319  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.65 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.86 
 
 
169 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.4 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3147  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.225101  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0214  PAP2 superfamily domain-containing protein  34.71 
 
 
273 aa  50.4  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  35.4 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.14 
 
 
176 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1171  Pap2  34.78 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00573838  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03667  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.89 
 
 
230 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2830  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.29 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626902  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1429  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.26 
 
 
293 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.7 
 
 
201 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.14 
 
 
178 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.65 
 
 
271 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.08 
 
 
168 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.7 
 
 
201 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.14 
 
 
178 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0393  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.63 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0402  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.63 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.63 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257956  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.65 
 
 
273 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1321  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.94 
 
 
238 aa  48.9  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.175223  normal  0.0541289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  32.71 
 
 
438 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2570  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.8 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.501729  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2844  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.82 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.46 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.85 
 
 
457 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1755  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.33 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.82 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.22 
 
 
187 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.13 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.71 
 
 
438 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.17 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.71 
 
 
438 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.78 
 
 
438 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  36.67 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1390  PAP2 family protein  33.93 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.686909  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl465  putative phosphatidylglycerophosphatase B  31.96 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.330397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3404  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.79 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.88 
 
 
208 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05520  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.64 
 
 
308 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000494508  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1477  hypothetical protein  23.53 
 
 
204 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769795  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.81 
 
 
194 aa  47  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1506  hypothetical protein  23.53 
 
 
204 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9017  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.25 
 
 
232 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  31.16 
 
 
199 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  34.69 
 
 
138 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4462  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.06 
 
 
224 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0262508  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  28.1 
 
 
217 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1858  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.87 
 
 
283 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0501  phosphoesterase PA-phosphatase related  20.97 
 
 
222 aa  46.6  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9009  hypothetical protein  39.53 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0429  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.12 
 
 
221 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.402808  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.3 
 
 
182 aa  46.2  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  24.8 
 
 
682 aa  46.2  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  24.8 
 
 
682 aa  46.2  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.35 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0110  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.81 
 
 
240 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1480  undecaprenyl-diphosphatase  28.57 
 
 
180 aa  45.8  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00409552  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2541  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  31.03 
 
 
214 aa  45.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  29.46 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1199  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.41 
 
 
207 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15070  PAP2 superfamily protein  31.16 
 
 
198 aa  45.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.872818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.15 
 
 
438 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.71 
 
 
255 aa  45.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.223489  normal  0.43198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  33.72 
 
 
438 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4104  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.58 
 
 
257 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2716  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  30.51 
 
 
199 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.179676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2665  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  30.51 
 
 
199 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160204 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2391  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  30.51 
 
 
199 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193299  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.56 
 
 
200 aa  45.4  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.28 
 
 
211 aa  45.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.55 
 
 
279 aa  45.4  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.87 
 
 
171 aa  45.4  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  30.22 
 
 
199 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.06 
 
 
157 aa  45.4  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
194 aa  45.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2430  PAP2 family protein  30.51 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000481219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  30.22 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.33 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0197  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.4 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>