More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0036 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0036  FHA domain protein  100 
 
 
233 aa  484  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1377  hypothetical protein  86.27 
 
 
233 aa  427  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0024  FHA domain containing protein  58.8 
 
 
235 aa  277  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0176  FHA domain containing protein  56.28 
 
 
238 aa  276  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.74043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00240  FHA domain-containing protein  56.03 
 
 
239 aa  267  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0031  FHA domain containing protein  55.31 
 
 
235 aa  260  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0032  FHA domain containing protein  50.43 
 
 
235 aa  238  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0077  FHA domain containing protein  42.24 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.43292  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26930  FHA domain-containing protein  39.91 
 
 
237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.583878  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0026  FHA domain-containing protein  38.24 
 
 
248 aa  161  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0026  FHA domain containing protein  37.55 
 
 
247 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0049  FHA domain-containing protein  37.04 
 
 
245 aa  159  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.0038838  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0117  FHA domain-containing protein-like protein  36.89 
 
 
246 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0069  FHA domain containing protein  36.18 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5252  FHA domain containing protein  37.15 
 
 
255 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.691426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3060  FHA domain-containing protein  35.86 
 
 
253 aa  149  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0028  forkhead-associated protein  33.19 
 
 
238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.791659  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0041  FHA domain containing protein  30.08 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2647  FHA domain containing protein  31.76 
 
 
234 aa  121  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4430  FHA domain-containing protein  31.28 
 
 
440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.206404 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0024  FHA domain-containing protein  27.6 
 
 
280 aa  112  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0140  FHA domain-containing protein  32.34 
 
 
533 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425814  hitchhiker  0.00649643 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  30.36 
 
 
252 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0047  FHA domain-containing protein  28.8 
 
 
253 aa  99.8  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.183651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6477  FHA domain-containing protein  28.74 
 
 
246 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0374778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0042  FHA domain-containing protein  28.4 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179739  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0033  FHA domain containing protein  36.36 
 
 
342 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0012  FHA domain containing protein  26.29 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421198  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00810  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
303 aa  90.1  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0576039  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  26.83 
 
 
245 aa  89  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  28.52 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00240  FHA domain-containing protein  45.05 
 
 
402 aa  82.8  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  25.32 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0092  FHA domain containing protein  27.85 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0026  FHA domain-containing protein  24.42 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  23.9 
 
 
279 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  25.75 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  24.57 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3849  FHA domain containing protein  24.81 
 
 
267 aa  72  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.149542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4978  FHA domain-containing protein  23.83 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.064902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  45.07 
 
 
863 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27030  FHA domain-containing protein  44.87 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0457  diguanylate cyclase  34.51 
 
 
326 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0458  diguanylate cyclase  34.51 
 
 
326 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  40.91 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3956  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.53 
 
 
455 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.382581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  35.4 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18260  FHA domain-containing protein  37.08 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0021  FHA domain-containing protein  30.6 
 
 
469 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0541775  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0029  FHA domain-containing protein  30.6 
 
 
469 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551957  hitchhiker  0.00992871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1738  FHA domain containing protein  37.65 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148575  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0021  FHA domain-containing protein  30.6 
 
 
469 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.371032  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.98 
 
 
899 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.74 
 
 
903 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  36.9 
 
 
177 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14970  FHA domain-containing protein  38.82 
 
 
152 aa  64.3  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0364194  normal  0.592543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3613  FHA domain containing protein  39.02 
 
 
157 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  hitchhiker  0.00128978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.54 
 
 
1004 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3128  FHA domain containing protein  37.5 
 
 
179 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3940  FHA domain-containing protein  44 
 
 
225 aa  62  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6711  putative sigma54 specific transcriptional regulator  37.04 
 
 
448 aa  62  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2382  forkhead-associated protein  38.64 
 
 
150 aa  62  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2520  FHA domain-containing protein  38.64 
 
 
150 aa  61.6  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0806  FHA domain-containing protein  31.62 
 
 
478 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4010  FHA domain containing protein  35.63 
 
 
156 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.196899  normal  0.106089 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0473  hypothetical protein  37.21 
 
 
147 aa  61.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592992  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03340  FHA domain-containing protein  41.03 
 
 
408 aa  60.5  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0411441  normal  0.659189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2434  FHA domain containing protein  38.27 
 
 
178 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00264365  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1302  FHA domain containing protein  35.29 
 
 
161 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3039  FHA domain containing protein  35.92 
 
 
414 aa  60.1  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15520  FHA domain-containing protein  40 
 
 
147 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2102  FHA domain containing protein  34.83 
 
 
174 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4680  FHA domain-containing protein  39.51 
 
 
219 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3612  FHA domain containing protein  35.64 
 
 
514 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  hitchhiker  0.00187032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1886  FHA domain containing protein  36.9 
 
 
156 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0328071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2726  FHA domain containing protein  37.5 
 
 
170 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0067  hypothetical protein  41.67 
 
 
220 aa  59.3  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4677  FHA domain-containing protein  42.35 
 
 
225 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0083  FHA domain containing protein  29.17 
 
 
394 aa  58.5  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1468  FHA domain-containing protein  36.14 
 
 
181 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4783  FHA domain-containing protein  39.29 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0798  FHA domain protein  38.82 
 
 
146 aa  58.2  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0865  FHA domain-containing protein  44 
 
 
237 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.646672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1309  FHA domain-containing protein  29.13 
 
 
206 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4997  FHA domain-containing protein  34.88 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  37.35 
 
 
153 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3388  FHA domain containing protein  37.5 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2775  Forkhead-associated protein  33.33 
 
 
149 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0029  FHA domain-containing protein  30 
 
 
470 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2339  FHA domain containing protein  35.8 
 
 
146 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.53176  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2044  FHA domain containing protein  40.66 
 
 
121 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3742  FHA domain-containing protein  37.65 
 
 
144 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4043  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 
211 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  51.61 
 
 
869 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0753  FHA domain containing protein  33.94 
 
 
138 aa  55.8  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000612633  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  32.06 
 
 
428 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.09 
 
 
878 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2114  FHA domain containing protein  37.21 
 
 
121 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.508953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2551  FHA domain containing protein  32.91 
 
 
206 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3096  FHA domain containing protein  35.56 
 
 
170 aa  55.5  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424895  normal  0.0108449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>