270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0035 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0035  FHA domain protein  100 
 
 
178 aa  366  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1378  hypothetical protein  55.98 
 
 
176 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0034  FHA domain containing protein  35.33 
 
 
175 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00230  FHA domain-containing protein  41.38 
 
 
160 aa  115  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.853372  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3061  FHA domain-containing protein  35.8 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0050  FHA domain-containing protein  35.23 
 
 
156 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00259691  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4431  FHA domain-containing protein  38.51 
 
 
165 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0076  FHA domain containing protein  34.66 
 
 
166 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103103  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0023  FHA domain-containing protein  35.8 
 
 
153 aa  105  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0030  FHA domain containing protein  38.76 
 
 
169 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0025  FHA domain-containing protein  32.39 
 
 
160 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0139  FHA domain-containing protein  36 
 
 
179 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0141963  hitchhiker  0.00495704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0116  FHA domain containing protein-like protein  34.66 
 
 
155 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851255  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5251  FHA domain containing protein  35.2 
 
 
168 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.462718 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0068  FHA domain containing protein  36.16 
 
 
166 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00410  FHA domain-containing protein  35.63 
 
 
156 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0027  forkhead-associated protein  34.09 
 
 
158 aa  99  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0026  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
154 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.259874  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0023  FHA domain containing protein  36.93 
 
 
170 aa  95.5  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10019  hypothetical protein  33.53 
 
 
155 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0341337  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0040  FHA domain containing protein  41.38 
 
 
154 aa  94.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906333  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0025  FHA domain containing protein  36.36 
 
 
160 aa  94.4  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26940  FHA domain-containing protein  36.52 
 
 
175 aa  94  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.216801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0043  FHA domain-containing protein  33.91 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140722  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0175  FHA domain containing protein  46.6 
 
 
152 aa  92  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545255  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0048  FHA domain-containing protein  33.14 
 
 
161 aa  91.3  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0807  FHA domain-containing protein  35.26 
 
 
168 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0028  FHA domain-containing protein  35.26 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6476  FHA domain-containing protein  34.27 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00800  FHA domain-containing protein  30.89 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.151264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0031  FHA domain containing protein  35.77 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.74184  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0032  FHA domain containing protein  45.16 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0020  FHA domain-containing protein  34.1 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0028  FHA domain-containing protein  34.1 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377029  hitchhiker  0.00774619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0020  FHA domain-containing protein  34.1 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.844855  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0082  FHA domain containing protein  43.3 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0030  Forkhead-associated protein  39.47 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0330  FHA domain-containing protein  41.84 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00230  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0338  FHA domain-containing protein  39.8 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0091  FHA domain containing protein  28.89 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  29.17 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3849  FHA domain containing protein  38.3 
 
 
267 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.149542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3848  FHA domain containing protein  40.24 
 
 
149 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3386  FHA domain-containing protein  39.36 
 
 
230 aa  62  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0029589  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1823  FHA domain-containing protein  37.89 
 
 
863 aa  61.6  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.997566  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  40 
 
 
245 aa  60.8  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3610  FHA domain-containing protein  34.78 
 
 
1083 aa  60.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133467  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  38.78 
 
 
252 aa  60.5  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  25.97 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1847  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  38 
 
 
675 aa  60.1  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0219  diguanylate cyclase  36.46 
 
 
303 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2478  FHA domain containing protein  38.55 
 
 
142 aa  59.3  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21520  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  34.29 
 
 
1488 aa  58.2  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2521  FHA domain-containing protein  36.96 
 
 
946 aa  58.2  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.295094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.84 
 
 
606 aa  57.8  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1342  FHA domain containing protein  38.36 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4519  hypothetical protein  34.15 
 
 
320 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1426  FHA domain containing protein  29.56 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  40.23 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2713  forkhead-associated protein  41.38 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3956  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.36 
 
 
455 aa  55.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.382581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  38.61 
 
 
294 aa  55.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0012  FHA domain containing protein  37.5 
 
 
252 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421198  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  32.63 
 
 
1065 aa  55.1  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3938  FHA domain-containing protein  36.25 
 
 
529 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.26 
 
 
863 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26930  FHA domain-containing protein  28.57 
 
 
237 aa  55.1  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.583878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3128  FHA domain containing protein  40.26 
 
 
179 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0047  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 
253 aa  54.3  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.183651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  38.75 
 
 
385 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  31.93 
 
 
388 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0013  FHA domain containing protein  32 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.943282  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0493  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.63 
 
 
1478 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1780  FHA domain-containing protein  37.08 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257566  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2060  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
154 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52887  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0895  FHA domain containing protein  40.51 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0026  FHA domain-containing protein  48.21 
 
 
280 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3611  FHA domain containing protein  35.48 
 
 
279 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331547  hitchhiker  0.0013234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.1 
 
 
1004 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0042  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 
262 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179739  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1693  FHA domain-containing protein  39.08 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514614  normal  0.923966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  33.7 
 
 
1011 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0753  FHA domain containing protein  35.23 
 
 
138 aa  52.4  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000612633  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0899  FHA domain containing protein  40.51 
 
 
122 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0874  FHA domain containing protein  32.05 
 
 
167 aa  52.8  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  34.41 
 
 
630 aa  52.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0140  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.64 
 
 
500 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0025  FHA domain-containing protein  35.37 
 
 
155 aa  52  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1125  FHA domain containing protein  38.38 
 
 
164 aa  52  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4010  FHA domain containing protein  37.76 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.196899  normal  0.106089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1468  FHA domain-containing protein  38.36 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4617  FHA domain containing protein  38.71 
 
 
387 aa  51.6  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15520  FHA domain-containing protein  35.79 
 
 
147 aa  51.6  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4997  FHA domain-containing protein  38.36 
 
 
221 aa  51.2  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3382  FHA domain containing protein  37.5 
 
 
564 aa  51.2  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.154424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5712  diguanylate cyclase  31.03 
 
 
316 aa  51.2  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  28.71 
 
 
279 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3613  FHA domain containing protein  35.56 
 
 
157 aa  50.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  hitchhiker  0.00128978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  40 
 
 
518 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>