More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0031 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  100 
 
 
320 aa  664    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  81.13 
 
 
316 aa  511  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  53.1 
 
 
444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0027  serine/threonine protein kinase  50.34 
 
 
473 aa  300  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0171  serine/threonine protein kinase  51.64 
 
 
575 aa  288  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.495174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0019  serine/threonine protein kinase  53.48 
 
 
556 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00190  serine/threonine protein kinase  51.03 
 
 
663 aa  282  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00760  probable pknA serine-threonine protein kinase  48.53 
 
 
704 aa  266  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0021  serine/threonine protein kinase  48.7 
 
 
610 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26980  serine/threonine protein kinase  47.45 
 
 
538 aa  260  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  48.33 
 
 
581 aa  260  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  41.92 
 
 
559 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  45.21 
 
 
445 aa  236  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  45.91 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  45.8 
 
 
596 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  46.27 
 
 
468 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4435  serine/threonine protein kinase  43.68 
 
 
542 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3065  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  47.01 
 
 
499 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.648627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  46.43 
 
 
469 aa  225  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.14 
 
 
614 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0023  protein kinase  48.82 
 
 
481 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  44.96 
 
 
497 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0028  serine/threonine protein kinase  45.98 
 
 
464 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0036  serine/threonine protein kinase  47.31 
 
 
614 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  43.94 
 
 
498 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.87 
 
 
562 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0811  protein kinase  46.72 
 
 
436 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0064  serine/threonine protein kinase  47.37 
 
 
538 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0024  protein kinase  46.33 
 
 
430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448385  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  43.91 
 
 
624 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0016  serine/threonine protein kinase  45.49 
 
 
443 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283317  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  41.96 
 
 
503 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  43.91 
 
 
624 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0024  protein kinase  45.49 
 
 
443 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  43.91 
 
 
624 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0016  serine/threonine protein kinase  45.49 
 
 
443 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00370  serine/threonine protein kinase  45.38 
 
 
419 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.339035 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10015  transmembrane serine/threonine-protein kinase A pknA  44.71 
 
 
431 aa  206  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.23 
 
 
603 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0052  serine/threonine protein kinase  40.59 
 
 
475 aa  205  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  43.55 
 
 
568 aa  205  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0047  protein kinase  40.59 
 
 
462 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576125  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  38.97 
 
 
666 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.78 
 
 
598 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  39.57 
 
 
615 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  43.85 
 
 
567 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3676  serine/threonine protein kinase  43.19 
 
 
501 aa  202  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.779668  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  42.58 
 
 
646 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  41.52 
 
 
597 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.64 
 
 
613 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  38.64 
 
 
465 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  41.57 
 
 
626 aa  200  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  39.54 
 
 
609 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  38.52 
 
 
1104 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  41.57 
 
 
618 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  41.18 
 
 
625 aa  198  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  42.25 
 
 
625 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0062  serine/threonine protein kinase  42.32 
 
 
548 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  40.7 
 
 
450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  42.75 
 
 
503 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.29 
 
 
645 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.71 
 
 
520 aa  197  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.09 
 
 
602 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 
763 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.5 
 
 
499 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.43 
 
 
658 aa  195  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  42.52 
 
 
581 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.07 
 
 
620 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 
554 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.97 
 
 
681 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 
612 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.68 
 
 
591 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  37.55 
 
 
692 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  39.53 
 
 
477 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  43.36 
 
 
480 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  37.17 
 
 
691 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.87 
 
 
627 aa  193  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  39.85 
 
 
668 aa  192  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.5 
 
 
667 aa  192  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  41.9 
 
 
651 aa  192  7e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.06 
 
 
676 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39 
 
 
647 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.57 
 
 
613 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  40.82 
 
 
533 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  40.3 
 
 
593 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.57 
 
 
505 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.3 
 
 
632 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1254  serine/threonine protein kinase  42.46 
 
 
522 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  41.26 
 
 
517 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  38.34 
 
 
634 aa  189  5e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.18 
 
 
757 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  39.22 
 
 
776 aa  188  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 
599 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  42.6 
 
 
582 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.3 
 
 
664 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  38 
 
 
757 aa  188  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.75 
 
 
584 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.38 
 
 
696 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  36.2 
 
 
368 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0689  kinase domain protein  37.04 
 
 
796 aa  186  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>