More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0023 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_01015  hypothetical protein similar to glycogen phosphorylase 1 (Broad)  43.15 
 
 
879 aa  639    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.202732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03269  maltodextrin phosphorylase  44.33 
 
 
797 aa  636    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000198557  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03280  glycogen phosphorylase  43.58 
 
 
815 aa  657    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0272942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0286  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.58 
 
 
815 aa  657    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0296  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.33 
 
 
797 aa  636    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307375  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0519  glycogen phosphorylase  44.92 
 
 
813 aa  652    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1705  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.88 
 
 
834 aa  691    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2066  glycogen phosphorylase  46.93 
 
 
836 aa  712    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5041  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.77 
 
 
816 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1533  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  42.1 
 
 
801 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.732219  normal  0.204022 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3628  glycogen phosphorylase  43.58 
 
 
815 aa  657    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0067  glycogen phosphorylase  47.32 
 
 
832 aa  673    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2540  glycogen phosphorylase  45.4 
 
 
836 aa  684    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.461812  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4002  glycogen phosphorylase  42.36 
 
 
815 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1798  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.65 
 
 
828 aa  639    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.362346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0296  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.33 
 
 
797 aa  636    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0204899  normal  0.0687014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3724  glycogen phosphorylase  43.83 
 
 
815 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1323  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.4 
 
 
843 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3801  glycogen phosphorylase  43.83 
 
 
815 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3993  maltodextrin phosphorylase  45.43 
 
 
801 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3615  maltodextrin phosphorylase  44.33 
 
 
797 aa  636    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2508  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.47 
 
 
822 aa  699    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.372187  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3790  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.25 
 
 
817 aa  683    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.727667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1989  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.22 
 
 
848 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1176  phosphorylase  45.47 
 
 
839 aa  664    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4232  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.9 
 
 
848 aa  735    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5144  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.69 
 
 
827 aa  679    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117324  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2056  phosphorylase  44.1 
 
 
837 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4122  glycogen phosphorylase  42.24 
 
 
815 aa  648    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.942595 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17881  phosphorylase  45.76 
 
 
854 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.441746  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4043  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.78 
 
 
859 aa  676    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.160668  normal  0.103786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02552  putative maltodextrin phosphorylase  44.62 
 
 
837 aa  677    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0284872  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2887  glycogen phosphorylase  42.1 
 
 
801 aa  650    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04849  maltodextrin phosphorylase  43.77 
 
 
817 aa  654    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0182  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.18 
 
 
840 aa  684    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0152  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.75 
 
 
840 aa  679    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0940  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.68 
 
 
838 aa  711    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2767  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.73 
 
 
835 aa  672    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3836  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.92 
 
 
815 aa  650    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.404476  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3088  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.46 
 
 
823 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1322  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.09 
 
 
864 aa  693    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0921  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.47 
 
 
839 aa  699    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0938734  normal  0.606568 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1693  phosphorylase  45.88 
 
 
848 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.77 
 
 
844 aa  694    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.79007 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18101  phosphorylase  45.76 
 
 
854 aa  679    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.28 
 
 
826 aa  685    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3843  glycogen phosphorylase  43.58 
 
 
815 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.400184  normal  0.614217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0422  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.01 
 
 
816 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.879107  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0864  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.38 
 
 
841 aa  692    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1359  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.53 
 
 
843 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.18855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4636  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.77 
 
 
801 aa  654    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1659  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.28 
 
 
807 aa  678    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3118  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.82 
 
 
793 aa  656    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986953  normal  0.22362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0511  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.87 
 
 
815 aa  655    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1105  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.73 
 
 
808 aa  681    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1390  glucan phosphorylase  76.82 
 
 
815 aa  1296    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.14638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3893  maltodextrin phosphorylase  44.33 
 
 
797 aa  636    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0879  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46 
 
 
846 aa  706    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400969  normal  0.0261229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1023  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46 
 
 
846 aa  706    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0471814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2201  phosphorylase  44.13 
 
 
817 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4643  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42 
 
 
815 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3896  glycogen phosphorylase  43.58 
 
 
815 aa  657    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17241  phosphorylase  45.76 
 
 
840 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0151  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.36 
 
 
815 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1333  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.28 
 
 
843 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1891  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.17 
 
 
842 aa  711    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1132  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.1 
 
 
801 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2197  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.65 
 
 
831 aa  679    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5091  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.89 
 
 
816 aa  648    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3710  glycogen phosphorylase  43.58 
 
 
815 aa  658    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.30951 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0161  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.43 
 
 
801 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.686596  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0885  glycogen phosphorylase  42.42 
 
 
819 aa  669    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0218  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.89 
 
 
850 aa  728    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.372597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3694  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.85 
 
 
849 aa  688    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6361  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.32 
 
 
832 aa  664    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196426  normal  0.63045 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3698  maltodextrin phosphorylase  44.33 
 
 
797 aa  637    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.411664 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20511  phosphorylase  45.47 
 
 
839 aa  664    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.694663  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5966  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.5 
 
 
817 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684528  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0909  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.14 
 
 
841 aa  690    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3907  glycogen phosphorylase  43.58 
 
 
815 aa  657    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2739  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43 
 
 
821 aa  677    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0130  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.98 
 
 
838 aa  640    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3854  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.36 
 
 
829 aa  726    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1470  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  48.79 
 
 
832 aa  740    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0341159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2957  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  48.12 
 
 
838 aa  730    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.815892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1520  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  41.48 
 
 
829 aa  661    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0549278  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3435  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.93 
 
 
824 aa  655    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.912321  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3076  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.41 
 
 
840 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0428621 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0119  maltodextrin phosphorylase  44.82 
 
 
817 aa  664    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0415  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.54 
 
 
833 aa  691    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2240  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.67 
 
 
829 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0942697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0284  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.58 
 
 
815 aa  658    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4429  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.63 
 
 
798 aa  679    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4915  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.65 
 
 
816 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.570439  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2661  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.02 
 
 
837 aa  713    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0880  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.01 
 
 
834 aa  643    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151922  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1192  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.34 
 
 
840 aa  691    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.823471  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25951  phosphorylase  45.22 
 
 
841 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1594  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.53 
 
 
870 aa  654    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17931  phosphorylase  45.95 
 
 
848 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>