39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0021 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0021  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  261  3e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.206071 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1392  hypothetical protein  56.25 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.343231  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4039  hypothetical protein  63.16 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.689031  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0297  hypothetical protein  55.56 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3514  hypothetical protein  66.67 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.365915 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2906  hypothetical protein  65.71 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0430043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0950  hypothetical protein  63.89 
 
 		 58 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2749  hypothetical protein  64.71 
 
 		 79 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0897128  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4389  hypothetical protein  62.16 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4537  hypothetical protein  43.55 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4624  hypothetical protein  43.55 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4920  hypothetical protein  43.55 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2350  hypothetical protein  60 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34070  hypothetical protein  64.71 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.254911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6842  hypothetical protein  60 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326485  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3738  hypothetical protein  62.16 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3552  hypothetical protein  59.46 
 
 		 55 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00116548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06070  hypothetical protein  61.11 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5982  hypothetical protein  61.11 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1637  hypothetical protein  51.06 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5110  hypothetical protein  55.56 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3087  hypothetical protein  61.11 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37790  hypothetical protein  61.76 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.214618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5041  hypothetical protein  58.33 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4314  hypothetical protein  62.86 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7208  hypothetical protein  41.94 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.073484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0158  hypothetical protein  52.27 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2070  hypothetical protein  54.76 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.936388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10825  hypothetical protein  55.56 
 
 		 60 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149368 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4756  hypothetical protein  55.56 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08980  hypothetical protein  60 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.645478  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3345  hypothetical protein  51.06 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  0.696912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0167  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459821  hitchhiker  0.00010611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0096  hypothetical protein  45.61 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3477  hypothetical protein  56.41 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8994  hypothetical protein  58.82 
 
 		 77 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0298  hypothetical protein  55.88 
 
 		 90 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3574  hypothetical protein  60.61 
 
 		 66 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.021517  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18640  hypothetical protein  51.11 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00906092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>