More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4429 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  60.15 
 
 
536 aa  667    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  59.4 
 
 
537 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
528 aa  1082    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  55.39 
 
 
531 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  55.6 
 
 
530 aa  571  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  54.55 
 
 
536 aa  567  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  52.66 
 
 
542 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  45.68 
 
 
542 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  39.89 
 
 
536 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  38.24 
 
 
556 aa  352  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37.68 
 
 
550 aa  348  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  38.67 
 
 
534 aa  339  9e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  40.04 
 
 
539 aa  336  5e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  40.13 
 
 
559 aa  332  8e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  39.56 
 
 
534 aa  332  9e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  35.61 
 
 
553 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  38.27 
 
 
552 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.8 
 
 
550 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  39.02 
 
 
548 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  36.46 
 
 
552 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.41 
 
 
553 aa  316  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.41 
 
 
558 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.41 
 
 
558 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.41 
 
 
558 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.41 
 
 
558 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.41 
 
 
558 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.41 
 
 
558 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.41 
 
 
558 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.49 
 
 
557 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.98 
 
 
553 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.06 
 
 
552 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.06 
 
 
552 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.98 
 
 
554 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.98 
 
 
554 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.34 
 
 
555 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.12 
 
 
554 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.7 
 
 
554 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.18 
 
 
552 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.06 
 
 
553 aa  302  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.91 
 
 
552 aa  302  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  34.65 
 
 
562 aa  300  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  40.69 
 
 
545 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  36.38 
 
 
545 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  34.59 
 
 
545 aa  295  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  35.97 
 
 
547 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.91 
 
 
555 aa  290  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.49 
 
 
555 aa  290  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  39.38 
 
 
544 aa  289  9e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  33.4 
 
 
562 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.64 
 
 
545 aa  286  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.75 
 
 
563 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  39.07 
 
 
544 aa  286  9e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.89 
 
 
567 aa  286  9e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  34.97 
 
 
551 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  38.58 
 
 
541 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  36.02 
 
 
550 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  33.58 
 
 
541 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  38.89 
 
 
541 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  34.89 
 
 
569 aa  282  9e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  38.89 
 
 
541 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  38.89 
 
 
541 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  38.89 
 
 
541 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  39.14 
 
 
541 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  39.04 
 
 
556 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0201  60 kDa inner membrane protein  34.66 
 
 
566 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  34.12 
 
 
557 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  38.74 
 
 
541 aa  281  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  38.35 
 
 
542 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.94 
 
 
548 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.74 
 
 
548 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  38.89 
 
 
541 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  40.38 
 
 
567 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.74 
 
 
548 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.74 
 
 
548 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  38.38 
 
 
541 aa  280  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  39.04 
 
 
556 aa  280  6e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2122  inner membrane protein oxaA  34.66 
 
 
566 aa  280  6e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.82 
 
 
560 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  38.64 
 
 
541 aa  279  8e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
548 aa  279  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.08 
 
 
546 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.08 
 
 
546 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.26 
 
 
575 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.08 
 
 
546 aa  279  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.75 
 
 
560 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  37.99 
 
 
566 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.75 
 
 
560 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.61 
 
 
560 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.86 
 
 
584 aa  277  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  37.68 
 
 
542 aa  276  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0032  inner membrane protein, 60 kDa  33.27 
 
 
528 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.07 
 
 
557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.16 
 
 
597 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  33.27 
 
 
528 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.13 
 
 
548 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.08 
 
 
541 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  33.74 
 
 
548 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.13 
 
 
548 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.13 
 
 
548 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.13 
 
 
548 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>