More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4365 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4365  response regulator receiver protein  100 
 
 		 340 aa  691    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3285  putative PAS/PAC sensor protein  56.94 
 
 		 516 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  56.94 
 
 		 516 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.92 
 
 		 941 aa  212  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40.54 
 
 		 389 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  38.92 
 
 		 391 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.05 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3449  response regulator receiver protein  33.23 
 
 		 371 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.45 
 
 		 726 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  52.35 
 
 		 649 aa  145  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.56 
 
 		 670 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.75 
 
 		 773 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.05 
 
 		 773 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.05 
 
 		 769 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.1 
 
 		 654 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.48 
 
 		 715 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1758  PAS sensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  50.38 
 
 		 700 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  44.44 
 
 		 637 aa  129  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1114  putative diguanylate phosphodiesterase  50.36 
 
 		 568 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1917  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  53.23 
 
 		 419 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0589316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.06 
 
 		 715 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.99155  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0393  putative GAF sensor protein  39.7 
 
 		 413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667086  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0405  serine phosphatase  39.7 
 
 		 413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  46.94 
 
 		 642 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0414  putative GAF sensor protein  39.7 
 
 		 413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.479373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  46.94 
 
 		 642 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1656  sensory box/response regulator  47.14 
 
 		 420 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.84 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000169909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2565  two component signal transduction response regulator  55.56 
 
 		 703 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.88 
 
 		 765 aa  122  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.274696 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.99 
 
 		 751 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.69 
 
 		 561 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.15 
 
 		 650 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  46.67 
 
 		 824 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1144  signal transduction protein  44.85 
 
 		 571 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.33 
 
 		 484 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5218  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  46.43 
 
 		 580 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0126538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2748  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.92 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0010  sensory box histidine kinase/response regulator  50 
 
 		 727 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1825  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  49.19 
 
 		 879 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  42.28 
 
 		 637 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2829  GAF domain-containing protein  36.6 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0493  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.28 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.88 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.06 
 
 		 563 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0476  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.54 
 
 		 431 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1191  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  54.62 
 
 		 836 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.668547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  31.9 
 
 		 1082 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1814  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  55.56 
 
 		 484 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3915  stage II sporulation E family protein  34.78 
 
 		 661 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.688937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.69 
 
 		 856 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3974  stage II sporulation E family protein  34.78 
 
 		 661 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3900  serine phosphatase  34.78 
 
 		 642 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.7 
 
 		 482 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  30.61 
 
 		 754 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  32.26 
 
 		 631 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  36.09 
 
 		 1087 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  34.85 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.17 
 
 		 590 aa  97.8  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.1 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2618  putative PAS/PAC sensor protein  40.7 
 
 		 685 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  34.31 
 
 		 853 aa  97.1  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  39.13 
 
 		 394 aa  96.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  30.58 
 
 		 463 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  31.31 
 
 		 423 aa  96.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  27.49 
 
 		 684 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  35.5 
 
 		 1087 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  33.16 
 
 		 469 aa  94.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.1 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.5 
 
 		 507 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  30.3 
 
 		 557 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3433  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 		 503 aa  93.6  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0364545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  29.41 
 
 		 474 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  29.76 
 
 		 460 aa  93.2  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04306  histidine kinase-response regulator hybrid protein  37.89 
 
 		 500 aa  93.6  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.717782  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  33.16 
 
 		 470 aa  92.8  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.07 
 
 		 467 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  29.28 
 
 		 379 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  29.72 
 
 		 1079 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.97 
 
 		 572 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  30.51 
 
 		 536 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  29.87 
 
 		 462 aa  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  33.65 
 
 		 453 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0564  putative signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  32.04 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  28.91 
 
 		 1083 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  30.21 
 
 		 477 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  46.36 
 
 		 488 aa  90.5  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  33.67 
 
 		 465 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  33.85 
 
 		 708 aa  90.1  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.86 
 
 		 371 aa  89.4  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.16 
 
 		 465 aa  89.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  30.56 
 
 		 521 aa  89.4  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.22 
 
 		 393 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.22 
 
 		 393 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.29 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  28.34 
 
 		 612 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>