More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4335 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  69.88 
 
 		 504 aa  728    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  63.71 
 
 		 501 aa  676    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 498 aa  1026    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  69.28 
 
 		 504 aa  712    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  72.06 
 
 		 502 aa  775    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  82.42 
 
 		 504 aa  849    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  55.96 
 
 		 503 aa  593  1e-168  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  56.12 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  55.83 
 
 		 509 aa  588  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  57.35 
 
 		 520 aa  589  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  55.15 
 
 		 503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  54.75 
 
 		 503 aa  579  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  56.03 
 
 		 500 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  54.19 
 
 		 498 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  51.52 
 
 		 493 aa  553  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  51.83 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  50.61 
 
 		 490 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  46.96 
 
 		 600 aa  456  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  44.26 
 
 		 546 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.99 
 
 		 522 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  40.44 
 
 		 529 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  40.61 
 
 		 524 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  40.62 
 
 		 525 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  39.96 
 
 		 523 aa  368  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.69 
 
 		 524 aa  363  3e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  40.36 
 
 		 527 aa  363  3e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  43.97 
 
 		 521 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  40.28 
 
 		 522 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  44.18 
 
 		 534 aa  359  8e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  38 
 
 		 533 aa  355  7.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  37.33 
 
 		 529 aa  355  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  38.59 
 
 		 529 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  41.84 
 
 		 529 aa  347  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  37.2 
 
 		 533 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  38.16 
 
 		 561 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  36.56 
 
 		 554 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  33.96 
 
 		 527 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  34.51 
 
 		 528 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  33.82 
 
 		 539 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  34.17 
 
 		 546 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  33.19 
 
 		 531 aa  270  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  34.47 
 
 		 523 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  36.04 
 
 		 547 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  35.8 
 
 		 547 aa  266  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  33.06 
 
 		 527 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  35.78 
 
 		 543 aa  266  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  35.8 
 
 		 547 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  36.38 
 
 		 532 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1712  radical SAM family protein  33.4 
 
 		 528 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5358  normal  0.03933 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  33.33 
 
 		 553 aa  262  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  32.7 
 
 		 527 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  32.99 
 
 		 542 aa  257  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  35.8 
 
 		 547 aa  253  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  32.29 
 
 		 527 aa  252  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  35.61 
 
 		 527 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  31.89 
 
 		 428 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  31.88 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  32.11 
 
 		 429 aa  186  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  29.95 
 
 		 439 aa  179  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  32.41 
 
 		 430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  29.48 
 
 		 444 aa  173  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 448 aa  169  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  31.57 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 		 486 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  32.46 
 
 		 490 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  31.02 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  27.23 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  30.57 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  30.71 
 
 		 471 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  30.71 
 
 		 471 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 449 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  27 
 
 		 483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 471 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  28.39 
 
 		 459 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  28.61 
 
 		 471 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 		 462 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 444 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  29.84 
 
 		 426 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  29.38 
 
 		 428 aa  133  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  28.88 
 
 		 475 aa  133  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.06 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.51 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.34 
 
 		 472 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.22 
 
 		 478 aa  127  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 		 477 aa  126  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  27.96 
 
 		 470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 476 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 		 473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 445 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 477 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1089  radical SAM family Fe-S protein  27 
 
 		 591 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.977516  normal  0.0200721 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.58 
 
 		 441 aa  110  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>