144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4319 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  100 
 
 		 354 aa  698    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  54.55 
 
 		 371 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  54.42 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1576  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.46 
 
 		 373 aa  318  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  52.6 
 
 		 455 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.83 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  30.81 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.25 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.82 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  28.81 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  28.1 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  28.07 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.79 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.76 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0951  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.78 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19730  putative inner membrane protein  32.94 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.0148656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  40.87 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.25 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2964  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.57 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  26.59 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  26.59 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.87 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.2 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  40 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  40 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  40 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  40 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  40 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.4 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.18 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.69 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2163  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.18 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  27.05 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.26 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0018382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  28.49 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  37.37 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4796  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.91 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.95 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.17 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6218  hypothetical protein  26.7 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2308  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.45 
 
 		 404 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984289 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1655  hypothetical protein  35.71 
 
 		 103 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000348591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71670  hypothetical protein  27.57 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.786799  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.23 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5055  YeeE/YedE  26.16 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.212129  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3607  hypothetical protein  26.56 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1179  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.03 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  27.01 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2823  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.1 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.52 
 
 		 176 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  27.91 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  27.91 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  27.91 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1068  hypothetical protein  27.45 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2173  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.15 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000368304  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5503  YeeE/YedE family protein  26.63 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.77 
 
 		 174 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0499  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.2 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1255  TolB periplamsic protein  25.86 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.588595 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  23.24 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.89 
 
 		 351 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317851  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4381  hypothetical protein  27.71 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  24.16 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.13 
 
 		 180 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.07 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1579  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.41 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.62 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.697139  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  31.13 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2704  putative inner membrane protein  26.62 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.74 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2029  putative inner membrane protein  26.62 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2164  putative inner membrane protein  26.62 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1710  putative inner membrane protein  26.62 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1252  putative inner membrane protein  26.62 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480893  normal  0.396989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  32.12 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2861  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.29 
 
 		 401 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  32.12 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  26.97 
 
 		 403 aa  53.5  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  28.07 
 
 		 401 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  28.07 
 
 		 401 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  28.07 
 
 		 401 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0732  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.98 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.90241  normal  0.157208 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  28.06 
 
 		 401 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  28.06 
 
 		 401 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  27.66 
 
 		 423 aa  53.5  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0688  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.98 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0342  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.38 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.140154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1059  putative inner membrane protein  25.86 
 
 		 401 aa  53.1  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000178842  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0677  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.97 
 
 		 380 aa  52.8  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2560  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.41 
 
 		 370 aa  52.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  26.18 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24.44 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  28.99 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.34 
 
 		 175 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.37 
 
 		 176 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.56 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  23.53 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  28.57 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1268  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24.73 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24.86 
 
 		 374 aa  50.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>