More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4239 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  89.46 
 
 
591 aa  1081    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3133  NADH dehydrogenase (quinone)  82.65 
 
 
590 aa  1004    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.846536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  54.82 
 
 
597 aa  657    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  55.56 
 
 
597 aa  643    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  54.56 
 
 
604 aa  646    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  57.21 
 
 
619 aa  658    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  54.38 
 
 
607 aa  638    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  56.57 
 
 
594 aa  657    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  56.05 
 
 
617 aa  649    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  87.76 
 
 
591 aa  1069    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  54.79 
 
 
592 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  89.71 
 
 
593 aa  1077    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  54.38 
 
 
607 aa  638    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
593 aa  1219    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  56.13 
 
 
597 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  90.05 
 
 
593 aa  1081    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  53.2 
 
 
597 aa  653    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  52.93 
 
 
610 aa  642    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  53.23 
 
 
596 aa  632  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  51.52 
 
 
597 aa  632  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  53.86 
 
 
603 aa  633  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  53.18 
 
 
602 aa  630  1e-179  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  55.89 
 
 
596 aa  629  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  52.98 
 
 
600 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  55.37 
 
 
619 aa  619  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  55.96 
 
 
598 aa  617  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  52.81 
 
 
624 aa  616  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  52.03 
 
 
590 aa  616  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  52.01 
 
 
636 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  51.1 
 
 
594 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  51.61 
 
 
636 aa  611  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  50.17 
 
 
614 aa  605  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  51.6 
 
 
626 aa  608  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  49.25 
 
 
614 aa  608  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  51.51 
 
 
596 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  51.53 
 
 
677 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  51.17 
 
 
629 aa  600  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  51.85 
 
 
595 aa  600  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1655  NADH dehydrogenase (quinone)  51.66 
 
 
627 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
656 aa  594  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0532  NADH dehydrogenase (quinone)  49.17 
 
 
620 aa  589  1e-167  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0280377  normal  0.055647 
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  51.51 
 
 
623 aa  587  1e-166  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  50.84 
 
 
623 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  51.01 
 
 
626 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  48.15 
 
 
640 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  50.42 
 
 
588 aa  578  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  49.08 
 
 
624 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  57.68 
 
 
485 aa  573  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  48.15 
 
 
635 aa  571  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0166  NADH dehydrogenase (quinone)  51.67 
 
 
612 aa  571  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  49.09 
 
 
623 aa  570  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  48.68 
 
 
634 aa  569  1e-161  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  50.08 
 
 
623 aa  571  1e-161  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  48.42 
 
 
626 aa  565  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  49.41 
 
 
641 aa  565  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  48.59 
 
 
626 aa  567  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  50.65 
 
 
572 aa  566  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  48.09 
 
 
604 aa  565  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  49.67 
 
 
624 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  48.41 
 
 
632 aa  564  1.0000000000000001e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  53.43 
 
 
488 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  49.41 
 
 
640 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  54.79 
 
 
486 aa  561  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  54.79 
 
 
486 aa  561  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  54.79 
 
 
486 aa  561  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  55.04 
 
 
572 aa  561  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  50.57 
 
 
552 aa  561  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  55.26 
 
 
526 aa  548  1e-154  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3516  NADH dehydrogenase (quinone)  54.89 
 
 
488 aa  546  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  49.53 
 
 
570 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0088  NADH dehydrogenase (quinone)  48.51 
 
 
628 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.296083  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  48.98 
 
 
562 aa  541  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  50.38 
 
 
535 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  48.24 
 
 
597 aa  535  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  52.27 
 
 
537 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  51.82 
 
 
543 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  51.01 
 
 
569 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  50.19 
 
 
535 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  52.71 
 
 
532 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  50.58 
 
 
530 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  51.18 
 
 
668 aa  514  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  50.47 
 
 
575 aa  515  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  47.35 
 
 
569 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  48.43 
 
 
562 aa  510  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  49.9 
 
 
535 aa  507  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0279  NADH dehydrogenase (quinone)  49.43 
 
 
534 aa  501  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  49.72 
 
 
539 aa  497  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0471  NADH dehydrogenase (quinone)  44.97 
 
 
620 aa  484  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000177124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0844  NADH dehydrogenase (quinone)  46.68 
 
 
562 aa  481  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0257852  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  44.11 
 
 
545 aa  480  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  44.11 
 
 
545 aa  479  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2794  NADH dehydrogenase (quinone)  48.67 
 
 
572 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1489  NADH dehydrogenase (quinone)  48.09 
 
 
570 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1539  NADH dehydrogenase (quinone)  44.57 
 
 
580 aa  473  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  42.54 
 
 
545 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  45.36 
 
 
571 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  43.15 
 
 
539 aa  442  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  41.35 
 
 
538 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  50.48 
 
 
407 aa  435  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>