More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4230 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 458 aa  928    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  51.6 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  50.22 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  50.11 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  50.91 
 
 		 437 aa  408  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  40.71 
 
 		 448 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  28.15 
 
 		 458 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  25.4 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  24.18 
 
 		 440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  25.39 
 
 		 515 aa  114  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 463 aa  107  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  22.85 
 
 		 470 aa  99  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  26.89 
 
 		 445 aa  92.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  26.11 
 
 		 441 aa  90.5  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 423 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  25.88 
 
 		 431 aa  88.2  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 473 aa  86.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 473 aa  86.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  24.56 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  28.44 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  22.52 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  26.26 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  23.27 
 
 		 523 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  25.61 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 431 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  26.92 
 
 		 627 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  24.27 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 972 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  23.16 
 
 		 449 aa  73.2  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 498 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  21.02 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.22 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  22.48 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  23.61 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  24.13 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 424 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  25.75 
 
 		 462 aa  67  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.92 
 
 		 489 aa  66.6  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.21 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  22.26 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.28 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.97 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  24.4 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2559  outer membrane efflux protein  24.75 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  27.41 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  25.19 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  27.65 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  21.45 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  27.65 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1557  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.63 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3941  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  21.41 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4051  outer membrane efflux protein  24.91 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337744  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 496 aa  60.1  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  23.12 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  27.57 
 
 		 520 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  28.24 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4084  outer membrane efflux protein  24.91 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  21.28 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  23.05 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.35 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  25.21 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1949  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.67 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.34 
 
 		 495 aa  57  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  24.14 
 
 		 576 aa  56.6  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  21.72 
 
 		 471 aa  57  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  22.35 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 635 aa  56.6  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2109  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.55 
 
 		 466 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 419 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>