More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4223 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  63.1 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 91 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  53.01 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  51.16 
 
 		 100 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 101 aa  89.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  50.6 
 
 		 94 aa  85.9  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  50.6 
 
 		 94 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  50 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  49.43 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  39.36 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  39.33 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  37.65 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  40.91 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0048  transcriptional regulator, ArsR family protein  38.37 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0663056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2171  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0439276  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2393  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0242789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  39.24 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0244  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10115e-49 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0166  transcriptional repressor PagR  45 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2463  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000234537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2201  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00183018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2140  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00329854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2123  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000110914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2328  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2996  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00129565  normal  0.033071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2363  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2382  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  42.53 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0221  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0200  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0013228  hitchhiker  4.7495300000000004e-23 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0207  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.239951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  38.82 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  39.73 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  38.37 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0268  transcriptional repressor PagR  40.23 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0145  transcriptional repressor PagR, putative  40.23 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5558  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249021 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5478  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.350529  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0320  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0127  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3065  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3305  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1906  regulatory protein ArsR  37.8 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  38.75 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.37 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>