More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4185 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  71.14 
 
 		 201 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  68 
 
 		 217 aa  289  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  64 
 
 		 200 aa  279  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  61 
 
 		 202 aa  270  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  54.27 
 
 		 213 aa  238  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  54.5 
 
 		 198 aa  224  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  54.5 
 
 		 198 aa  222  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  37.82 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  38.3 
 
 		 591 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  39.68 
 
 		 256 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  40.11 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  36.79 
 
 		 200 aa  128  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  36.13 
 
 		 197 aa  128  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.08 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.54 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 440 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 402 aa  111  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 412 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  40.12 
 
 		 224 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.09 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 155 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30.73 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  30.05 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 		 411 aa  106  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30 
 
 		 427 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  35.68 
 
 		 383 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.05 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 		 378 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  34 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.57 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.57 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  30.05 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  31.65 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  35.18 
 
 		 220 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  35.18 
 
 		 220 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  34.67 
 
 		 229 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.41 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  36 
 
 		 229 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 		 240 aa  97.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  34.17 
 
 		 223 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 220 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 220 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 220 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  27.41 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 201 aa  96.3  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  29.02 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.65 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  37.79 
 
 		 229 aa  95.5  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 214 aa  95.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  28.5 
 
 		 203 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.8 
 
 		 442 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.43 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  35.14 
 
 		 189 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  34.17 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.81 
 
 		 382 aa  92  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  35.15 
 
 		 452 aa  91.7  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.59 
 
 		 378 aa  91.7  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.45 
 
 		 191 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 220 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 217 aa  91.7  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 226 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 		 220 aa  91.3  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 		 445 aa  91.7  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 203 aa  91.3  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  31.01 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 226 aa  91.3  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 218 aa  90.5  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  33.67 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  31.65 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.27 
 
 		 442 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 449 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>