215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4153 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  100 
 
 		 168 aa  343  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  85.54 
 
 		 168 aa  297  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  77.98 
 
 		 168 aa  280  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  77.11 
 
 		 168 aa  277  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  66.46 
 
 		 165 aa  223  8e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  58.9 
 
 		 164 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  62.99 
 
 		 164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  59.63 
 
 		 164 aa  193  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  58.39 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  60 
 
 		 163 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  65.38 
 
 		 163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  61.35 
 
 		 169 aa  181  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  58.28 
 
 		 167 aa  181  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  57.76 
 
 		 164 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  58.54 
 
 		 165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  55.9 
 
 		 166 aa  178  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  56.25 
 
 		 165 aa  177  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  58.82 
 
 		 166 aa  175  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  55 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  58.17 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  60 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  54.66 
 
 		 166 aa  173  8e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  53.66 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  54.37 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  54.37 
 
 		 165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  53.42 
 
 		 166 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  51.85 
 
 		 166 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  52.44 
 
 		 165 aa  168  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  54.6 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  53.37 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  53.37 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  51.55 
 
 		 164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  51.22 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  49.38 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  49.39 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  54.19 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  48.12 
 
 		 167 aa  151  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  48.78 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  49.38 
 
 		 173 aa  147  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  48.78 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  47.56 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  46.58 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  45 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  47.24 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  48.15 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  48.15 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  46.2 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  48.15 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  46.79 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  46.91 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  44.51 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  43.64 
 
 		 184 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  44.24 
 
 		 184 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  45.51 
 
 		 185 aa  130  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  43.45 
 
 		 184 aa  127  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  41.76 
 
 		 182 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  41.38 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  41.71 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  43.51 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  51.11 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  42.24 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  51.13 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  50 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  48.87 
 
 		 139 aa  118  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  50.75 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  50 
 
 		 139 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  50.38 
 
 		 140 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  37.14 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  48.87 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  48.87 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  48.87 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  50.38 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  50.38 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  48.87 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  48.87 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  48.87 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  48.87 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  48.87 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  50.38 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  50.38 
 
 		 140 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  44.07 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  48.87 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  43.2 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  49.62 
 
 		 140 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  43.2 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  49.28 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  48.12 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  40.94 
 
 		 228 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  48.87 
 
 		 139 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  47.37 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  48.12 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  48.12 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  48.12 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  48.12 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  48.12 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  41.32 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  45.52 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  40.36 
 
 		 392 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  45.71 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  40.13 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>