More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4131 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  82.3 
 
 
418 aa  703    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  80.38 
 
 
418 aa  712    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.46 
 
 
418 aa  663    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  85.37 
 
 
418 aa  718    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
418 aa  855    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.54 
 
 
418 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  81.1 
 
 
418 aa  715    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.02 
 
 
418 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.43 
 
 
418 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.08 
 
 
416 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.56 
 
 
423 aa  486  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.2 
 
 
418 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.69 
 
 
414 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.48 
 
 
418 aa  471  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 
419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.67 
 
 
414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.93 
 
 
419 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.56 
 
 
418 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.78 
 
 
434 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.07 
 
 
419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.88 
 
 
419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0431  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.58 
 
 
448 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.87 
 
 
456 aa  451  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.04 
 
 
418 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  53 
 
 
418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0321  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.13 
 
 
435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.49 
 
 
415 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.24 
 
 
415 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.98 
 
 
430 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0291  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.24 
 
 
425 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000393853  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.57 
 
 
421 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.74 
 
 
418 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.85 
 
 
427 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.25 
 
 
416 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 
446 aa  435  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.97 
 
 
415 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.49 
 
 
411 aa  433  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.34 
 
 
420 aa  432  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 
415 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.82 
 
 
415 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.82 
 
 
415 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0441  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.84 
 
 
423 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  53 
 
 
418 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.58 
 
 
415 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 
420 aa  428  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0762  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.98 
 
 
415 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  53.73 
 
 
423 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.77 
 
 
418 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1215  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.22 
 
 
419 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4145  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.44 
 
 
413 aa  425  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.86 
 
 
425 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.73 
 
 
418 aa  424  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3015  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 
415 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.4 
 
 
417 aa  418  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
416 aa  418  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.24 
 
 
417 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.57 
 
 
419 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.31 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.07 
 
 
418 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0612  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.35 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642668 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.07 
 
 
418 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.96 
 
 
423 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.74 
 
 
421 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.39 
 
 
415 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.95 
 
 
421 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.14 
 
 
424 aa  414  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 
424 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.05 
 
 
423 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.56 
 
 
429 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.29 
 
 
423 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.38 
 
 
413 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 
423 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0115  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 
415 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
421 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.58 
 
 
423 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1633  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.19 
 
 
419 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565136  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
423 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.97 
 
 
425 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2672  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.86 
 
 
424 aa  408  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322038  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.82 
 
 
423 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.72 
 
 
430 aa  411  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4425  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 
415 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4285  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 
415 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.58 
 
 
423 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.08 
 
 
421 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4238  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 
415 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.58 
 
 
435 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.87 
 
 
426 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.6 
 
 
421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.63 
 
 
426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 
421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0083  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.4 
 
 
418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.67 
 
 
413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.81 
 
 
424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.06 
 
 
426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 
423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.76 
 
 
420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.03 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.6 
 
 
419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>