More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4098 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
298 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  66.33 
 
 
298 aa  421  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  65.77 
 
 
294 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  40.39 
 
 
306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  41.04 
 
 
306 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  33.33 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  38.21 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  35.59 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  33.65 
 
 
309 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  32.17 
 
 
315 aa  169  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  32.89 
 
 
297 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  31.8 
 
 
305 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  32.67 
 
 
295 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  31.35 
 
 
301 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  28.96 
 
 
292 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  29.74 
 
 
301 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  29.9 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  31.48 
 
 
301 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  30.89 
 
 
327 aa  135  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  32.35 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  30.03 
 
 
298 aa  132  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  28.05 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  31.48 
 
 
305 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  29.04 
 
 
298 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  29.7 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  29.26 
 
 
311 aa  125  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  27.61 
 
 
292 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  28.1 
 
 
300 aa  122  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  26.43 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  30.72 
 
 
294 aa  119  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  29.22 
 
 
302 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  30.92 
 
 
295 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  29.32 
 
 
295 aa  116  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1705  flagellar hook-associated protein FlgL  26.94 
 
 
287 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  29.03 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  26.35 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  26.26 
 
 
287 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  26.26 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1556  flagellar hook-associated protein FlgL  27.24 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  26.26 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  28.32 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  28.29 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1527  flagellar hook-associated protein FlgL  25.59 
 
 
287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  29.07 
 
 
305 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  27.97 
 
 
317 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  27.97 
 
 
317 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  27.27 
 
 
317 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3641  flagellar hook-associated protein FlgL  25.93 
 
 
287 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  27.62 
 
 
317 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  25.59 
 
 
287 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  27.62 
 
 
317 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  26.92 
 
 
317 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  27.27 
 
 
317 aa  106  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  25.59 
 
 
287 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  25.94 
 
 
317 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  27.33 
 
 
296 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  28.21 
 
 
305 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  27.05 
 
 
326 aa  99.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  26.81 
 
 
317 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  26.81 
 
 
317 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  26.81 
 
 
317 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  26.81 
 
 
317 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  26.81 
 
 
317 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  25.99 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  24.84 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  27.8 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  27.8 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  25.81 
 
 
305 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  24.53 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2610  flagellar hook-associated protein 3  27.85 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00831645  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  23.51 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  31.58 
 
 
870 aa  90.1  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1019  flagellar hook-associated protein 3  27.02 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4781  flagellar hook-associated protein 3  27.05 
 
 
319 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.892762  normal  0.741415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  26.98 
 
 
313 aa  89  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3704  flagellar hook-associated protein 3  27.05 
 
 
319 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.218733  normal  0.125395 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2514  flagellar hook-associated protein 3  27.52 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0170039  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2917  flagellin-like protein  29.37 
 
 
276 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  24.84 
 
 
316 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  25.6 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  24.36 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  26.05 
 
 
304 aa  86.3  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1343  flagellar hook-associated protein FlgL  28.86 
 
 
294 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0130628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  35 
 
 
438 aa  85.5  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  32.93 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  24.44 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  28.31 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  33.78 
 
 
594 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  31.51 
 
 
507 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1878  flagellar hook-associated protein FlgL  24.67 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  33.1 
 
 
504 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  24.19 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1563  flagellar hook-associated protein 3  26.37 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  32.41 
 
 
523 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  32.48 
 
 
514 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  23.9 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  29.57 
 
 
530 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  23.77 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0612  flagellar hook-associated protein 3  26.96 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.403095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>