More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4061 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 355 aa  727    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  82.82 
 
 		 355 aa  620  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  81.41 
 
 		 355 aa  615  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  85.27 
 
 		 354 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  82.54 
 
 		 355 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  82.58 
 
 		 359 aa  594  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  82.87 
 
 		 359 aa  595  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  67.71 
 
 		 356 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  61.86 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  57.67 
 
 		 356 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  58.82 
 
 		 357 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 363 aa  443  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  56.82 
 
 		 360 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  56.82 
 
 		 360 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  57.83 
 
 		 357 aa  436  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  56.21 
 
 		 355 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 356 aa  431  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  58.91 
 
 		 363 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  58.45 
 
 		 360 aa  433  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  60.12 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  56.58 
 
 		 359 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  57.58 
 
 		 360 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  57.67 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  56.73 
 
 		 360 aa  428  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 		 360 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  57.46 
 
 		 360 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  57.18 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  58.76 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  58.03 
 
 		 355 aa  425  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  57.31 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 		 356 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  59.6 
 
 		 357 aa  424  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  57.58 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  57.18 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 360 aa  424  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 363 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  57.18 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  57.18 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  57.8 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  59.72 
 
 		 357 aa  421  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 		 361 aa  423  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  56.29 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  58.05 
 
 		 361 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 359 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  57.59 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  57.95 
 
 		 353 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  57.79 
 
 		 360 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  59.48 
 
 		 360 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  56.62 
 
 		 360 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  56.36 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  60.39 
 
 		 359 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  56.65 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  56.45 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  56.98 
 
 		 360 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  56.34 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  55.77 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  60.39 
 
 		 359 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  56.34 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  56.45 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  57.83 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  55.81 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01186  peptide chain release factor 1  58.12 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  58.12 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  58.12 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000608431  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1316  peptide chain release factor 1  58.12 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  58.12 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  0.000030401 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 362 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 362 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  55.3 
 
 		 362 aa  413  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  55.21 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  55.21 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1692  peptide chain release factor 1  58.12 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0012914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  55.21 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1375  peptide chain release factor 1  58.12 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017097  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  55.65 
 
 		 358 aa  413  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01196  hypothetical protein  58.12 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.26987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 358 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1411  peptide chain release factor 1  55.3 
 
 		 362 aa  413  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1359  peptide chain release factor 1  58.12 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000344623  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  58.07 
 
 		 361 aa  411  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 358 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  60.68 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  54.47 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1913  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 360 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 		 370 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  60.4 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5314  peptide chain release factor 1  58.12 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 370 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>