191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4011 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  756    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  74.39 
 
 		 376 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  72.05 
 
 		 376 aa  518  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  67.47 
 
 		 378 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  66.67 
 
 		 378 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  57.07 
 
 		 451 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  52.96 
 
 		 375 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  49.46 
 
 		 398 aa  362  8e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  42.63 
 
 		 396 aa  275  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  41.69 
 
 		 383 aa  275  7e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  39.47 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  38.18 
 
 		 398 aa  243  6e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  38.02 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  36.84 
 
 		 375 aa  238  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  40 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  36.83 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  37.1 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  36.34 
 
 		 376 aa  230  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  39.22 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  37.99 
 
 		 392 aa  228  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  39.87 
 
 		 323 aa  220  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  38.87 
 
 		 318 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  35.36 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  37.75 
 
 		 323 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  39.53 
 
 		 320 aa  210  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  38.19 
 
 		 319 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  33.06 
 
 		 378 aa  209  8e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  37.86 
 
 		 319 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  38.76 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  38.49 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  35.73 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  34.73 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  33.51 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  33.96 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  33.96 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  30.09 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  36.97 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  31.48 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  32.71 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  31.15 
 
 		 396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  34.89 
 
 		 301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  30.77 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28 
 
 		 618 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  31.46 
 
 		 306 aa  103  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  32.65 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  29.04 
 
 		 282 aa  97.1  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  31.16 
 
 		 331 aa  90.9  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  32.51 
 
 		 318 aa  89.7  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  30.99 
 
 		 347 aa  89.4  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  31.43 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  27.47 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  29.55 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  25.78 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  30.59 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  24.3 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  29.11 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  29.82 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  30.1 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  28.51 
 
 		 332 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  31.33 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  27.2 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  27.8 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  27.62 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  24.81 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  28.08 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  28.9 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  29.67 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  28.4 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.77 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  28.85 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  24.83 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  24.83 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  26.77 
 
 		 505 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  28.5 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  23.89 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1825  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  42.86 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  29.66 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1215  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.16 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  26.58 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0531  hypothetical protein  37.7 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.450062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  39.34 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  25.11 
 
 		 261 aa  53.1  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1376  pyruvate synthase subunit porD  37.5 
 
 		 102 aa  49.7  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.010194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1709  pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase, gamma subunit  32.1 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0681484  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00229195  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1001  pyruvate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  34.33 
 
 		 95 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0875  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  38.6 
 
 		 99 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000569168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  24.54 
 
 		 306 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0213  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 547 aa  48.1  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  28.92 
 
 		 632 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0147  ech hydrogenase subunit F  38.89 
 
 		 122 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.28 
 
 		 292 aa  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1001  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35 
 
 		 656 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0909  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35 
 
 		 657 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.88 
 
 		 261 aa  47.4  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 131 aa  47.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.188784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  26.42 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  26.42 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0386  hypothetical protein  40 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.590413 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>