86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3915 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3915  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  224  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0084  hypothetical protein  60 
 
 
118 aa  144  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.033356  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2734  addiction module killer protein  58.18 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1245  addiction module killer protein  60.95 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2122  addiction module killer protein  51.43 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6456  addiction module killer protein  53.77 
 
 
108 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4242  addiction module killer protein  54.37 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4762  addiction module killer protein  51.46 
 
 
108 aa  105  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.621816  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4612  addiction module killer protein  53.4 
 
 
108 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1307  hypothetical protein  40.37 
 
 
115 aa  94  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000276635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0684  hypothetical protein  54.88 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00337855  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1836  hypothetical protein  46.94 
 
 
115 aa  90.9  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.204816  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2241  addiction module killer protein  41.18 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3122  hypothetical protein  38.74 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3001  addiction module killer protein  41.51 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36110  hypothetical protein  43.4 
 
 
111 aa  80.1  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5374  hypothetical protein  39.05 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000336277  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0172  addiction module killer protein  44.32 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916333  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0016  probable addiction module killer protein  37.84 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.299758  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3503  addiction module killer protein  39.05 
 
 
110 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.149451  hitchhiker  0.00969032 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5334  hypothetical protein  39.05 
 
 
110 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723187  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3599  hypothetical protein  36.79 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164625  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4138  hypothetical protein  38.74 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0172764  normal  0.111049 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1183  hypothetical protein  38.74 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18062  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0419  hypothetical protein  40.43 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.366932  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0367  addiction module killer protein  35.45 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.247793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3081  hypothetical protein  44.57 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2958  hypothetical protein  36.04 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  0.740348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2516  hypothetical protein  36.79 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.726824  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3921  addiction module killer protein  36.19 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315086  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4221  hypothetical protein  36.79 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3349  hypothetical protein  36.7 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000920139  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4549  addiction module killer protein  40.22 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6940  hypothetical protein  40.43 
 
 
97 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112291  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1253  addiction module killer protein  42.39 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3154  addiction module killer protein  39.33 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429668  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0862  hypothetical protein  38.04 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622779  normal  0.178504 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2823  addiction module killer protein  38.04 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.299861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40600  hypothetical protein  39.53 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4017  hypothetical protein  35.87 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3673  addiction module killer protein  45.45 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4948  addiction module killer protein  40.45 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583991  normal  0.477972 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0450  hypothetical protein  37.36 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0910099  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1444  hypothetical protein  36.96 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0277  putative addiction module killer protein  33.65 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2536  hypothetical protein  37.63 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4036  addiction module killer protein  35.16 
 
 
100 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1221  addiction module killer protein  40.96 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.958057  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3175  addiction module killer protein  40.43 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2533  hypothetical protein  39.76 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000474289 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3781  hypothetical protein  44.32 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.519742  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3742  addiction module killer protein  44.32 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.655044 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4582  hypothetical protein  44.32 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.213587  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0569  addiction module killer protein  38.55 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.443198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0607  addiction module killer protein  37.08 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2689  hypothetical protein  35.42 
 
 
98 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1814  hypothetical protein  35.42 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0041  addiction module killer protein  38.37 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2739  hypothetical protein  35.42 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3266  addiction module killer protein  32.98 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4951  addiction module killer protein  39.33 
 
 
105 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1302  addiction module killer protein  35.87 
 
 
112 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0501  hypothetical protein  39.02 
 
 
115 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0236  addiction module killer protein  36.14 
 
 
95 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0050  addiction module killer protein  29.03 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0225  hypothetical protein  31.91 
 
 
105 aa  53.9  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0568  hypothetical protein  44.83 
 
 
86 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2313  hypothetical protein  42.05 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0855  addiction module killer protein  35.16 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503668  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2208  addiction module killer protein  38.75 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.63367  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0185  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4469  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5508  hypothetical protein  40.91 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8269  addiction module killer protein  33.68 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2008  hypothetical protein  34.31 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0457  hypothetical protein  32.61 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2671  hypothetical protein  36.26 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0899  addiction module killer protein  34.88 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000789076  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05544  hypothetical protein  46.55 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6312  addiction module killer protein  32.97 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0289736  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0570  addiction module killer protein  37.93 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  unclonable  0.00000000000132448  unclonable  2.98787e-21 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3988  hypothetical protein  41.18 
 
 
51 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3745  addiction module killer protein  31.11 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117851  hitchhiker  0.00174099 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4554  hypothetical protein  47.92 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0440351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1331  addiction module killer protein  52.63 
 
 
48 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0428301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1687  addiction module killer protein  40.91 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>