172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3914 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 		 282 aa  584  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  81.14 
 
 		 285 aa  478  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  69.29 
 
 		 283 aa  425  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  68.79 
 
 		 283 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  68.44 
 
 		 283 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  71.32 
 
 		 296 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  66.67 
 
 		 281 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  54.51 
 
 		 293 aa  311  5.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  53.79 
 
 		 289 aa  311  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  51.25 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  50.53 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  50.9 
 
 		 282 aa  285  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  49.47 
 
 		 293 aa  279  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  48.75 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  45.2 
 
 		 326 aa  255  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  44.17 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  48.09 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  45.68 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  44.29 
 
 		 280 aa  241  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  43.77 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  43.77 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  43.42 
 
 		 275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  43.56 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  43.77 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  44.32 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  42.91 
 
 		 282 aa  225  7e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  40.94 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  42.37 
 
 		 281 aa  223  4e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  41.29 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  41.52 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  43.28 
 
 		 281 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  42.86 
 
 		 295 aa  217  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  42.48 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  43.87 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  41.99 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  43.87 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  44.03 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  43.87 
 
 		 285 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  43.87 
 
 		 285 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  43.87 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  43.87 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  43.87 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  42.91 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  43.49 
 
 		 285 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  42.5 
 
 		 286 aa  214  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  42.16 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  43.49 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  43.49 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  41.49 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  43.49 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  43.49 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  43.49 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  43.02 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  43.49 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  40.75 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  41.42 
 
 		 290 aa  212  7e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  41.28 
 
 		 282 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  38.52 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  42.11 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  39.93 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  40.15 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  39.22 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  40.3 
 
 		 279 aa  209  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  40.67 
 
 		 279 aa  208  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  42.86 
 
 		 288 aa  208  7e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  41.42 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  40.84 
 
 		 283 aa  205  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  39.3 
 
 		 282 aa  205  8e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  40.91 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  40.3 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  40 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  39.43 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  42.26 
 
 		 284 aa  201  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  39.78 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2675  endonuclease IV  39.93 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1532  endonuclease IV  39.93 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212021  normal  0.133835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2756  endonuclease IV  39.93 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0855606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  40.38 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  37.78 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  37.23 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  36.97 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  39.03 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  39.39 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  36.62 
 
 		 287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  38.87 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  39.1 
 
 		 298 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  39.1 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  39.1 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  39.1 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  37.13 
 
 		 379 aa  187  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  39.1 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  39.1 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  37.41 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  38.93 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  39.1 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  39.1 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0392  endonuclease IV  37.4 
 
 		 292 aa  185  6e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.907321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  38.72 
 
 		 298 aa  185  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  39.47 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  35.34 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>