More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3876 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  100 
 
 		 297 aa  607  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  60.47 
 
 		 301 aa  316  3e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  58.04 
 
 		 264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  54.69 
 
 		 278 aa  302  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  55.77 
 
 		 292 aa  300  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  59.66 
 
 		 280 aa  296  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  54.17 
 
 		 273 aa  295  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  52.14 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  55.83 
 
 		 254 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  60.52 
 
 		 267 aa  285  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 		 278 aa  285  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  57.03 
 
 		 295 aa  285  5e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  56.6 
 
 		 254 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  54.94 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  55.7 
 
 		 254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  56.96 
 
 		 251 aa  278  9e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  54.43 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  55.22 
 
 		 269 aa  275  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  57.21 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  53.42 
 
 		 258 aa  273  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  54.94 
 
 		 253 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  52.16 
 
 		 261 aa  269  5e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  49.81 
 
 		 267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  54.31 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  54.27 
 
 		 254 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  51.98 
 
 		 260 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  51.17 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  47.86 
 
 		 274 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 272 aa  260  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 272 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  51.08 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  52.54 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.08 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  51.69 
 
 		 272 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  50.67 
 
 		 256 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  51.29 
 
 		 286 aa  258  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  46.89 
 
 		 267 aa  258  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  50.2 
 
 		 272 aa  258  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  48.83 
 
 		 256 aa  258  9e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  52.16 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  48.02 
 
 		 259 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  48.84 
 
 		 263 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  51.95 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  53.95 
 
 		 253 aa  256  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 281 aa  255  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  51.85 
 
 		 273 aa  255  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  48.95 
 
 		 257 aa  254  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  52.54 
 
 		 308 aa  254  9e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.25 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  46.25 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  46.59 
 
 		 304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  46.36 
 
 		 266 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  48.63 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  50.87 
 
 		 279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  51.53 
 
 		 304 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  50.22 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  49.15 
 
 		 273 aa  252  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 		 264 aa  252  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  52.17 
 
 		 306 aa  251  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  50 
 
 		 286 aa  252  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.42 
 
 		 259 aa  252  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  51.33 
 
 		 259 aa  251  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  50.44 
 
 		 259 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  48.02 
 
 		 261 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  46.52 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  47.04 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  50.44 
 
 		 259 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.41 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  48.12 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  48.57 
 
 		 293 aa  249  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  51.91 
 
 		 246 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  48.57 
 
 		 293 aa  248  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  49.61 
 
 		 272 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  46.07 
 
 		 287 aa  248  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 263 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.46 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  47.35 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  44.37 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  49.14 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  49.79 
 
 		 275 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  48.16 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 260 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  46.25 
 
 		 267 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  49 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  48.55 
 
 		 267 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  51.53 
 
 		 258 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  45.88 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  49.79 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  49.79 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  43.08 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  44.66 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.46 
 
 		 256 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  48 
 
 		 271 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  48 
 
 		 271 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  49.36 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  48.79 
 
 		 257 aa  242  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.46 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  47.28 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>