28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3853 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  478  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  63.09 
 
 		 233 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  62.07 
 
 		 233 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  34.58 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  30.19 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  28.21 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  34.66 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3499  hypothetical protein  29.45 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  30.19 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  30.49 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  29.51 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  24.56 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  25.88 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  25.88 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  27.97 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  25.54 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2390  hypothetical protein  27.43 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  0.832106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  25.13 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0985  putative lipoprotein  29.74 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  22.87 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2114  putative lipoprotein  25.9 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.458545  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5161  hypothetical protein  27.74 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  26.29 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  26.29 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2893  lipoprotein  23.56 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000297735  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2721  hypothetical protein  25.9 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116183  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1774  hypothetical protein  22.77 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  23.12 
 
 		 273 aa  42  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>