More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3813 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  100 
 
 		 711 aa  1464    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  40.49 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  51.3 
 
 		 438 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  42.82 
 
 		 488 aa  302  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  40.88 
 
 		 450 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  40.58 
 
 		 449 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  59.92 
 
 		 415 aa  291  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  58.97 
 
 		 393 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.97 
 
 		 393 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  55.28 
 
 		 468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.46 
 
 		 454 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  39.22 
 
 		 870 aa  280  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 		 390 aa  280  7e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  60.17 
 
 		 390 aa  280  7e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  38.65 
 
 		 437 aa  277  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  54.1 
 
 		 816 aa  277  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  38.29 
 
 		 464 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  40.3 
 
 		 448 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  38.38 
 
 		 478 aa  273  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 469 aa  273  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 		 465 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 		 465 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 471 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 		 465 aa  271  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 		 465 aa  271  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  37.72 
 
 		 410 aa  271  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  40.1 
 
 		 435 aa  271  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 		 465 aa  271  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  52.72 
 
 		 472 aa  271  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.62 
 
 		 469 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  53.91 
 
 		 429 aa  269  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  40.37 
 
 		 457 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  52.42 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  42.9 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  56.42 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  36.3 
 
 		 472 aa  265  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  51.69 
 
 		 456 aa  265  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  48.32 
 
 		 416 aa  257  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  51.05 
 
 		 498 aa  253  9.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  37.24 
 
 		 455 aa  252  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  37.56 
 
 		 406 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  35.29 
 
 		 432 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  49.16 
 
 		 472 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  36.86 
 
 		 406 aa  246  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  35.42 
 
 		 394 aa  246  8e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  44.6 
 
 		 428 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  49.36 
 
 		 436 aa  246  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  45.42 
 
 		 420 aa  243  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  37.31 
 
 		 424 aa  241  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  46.83 
 
 		 415 aa  239  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  46.18 
 
 		 392 aa  239  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  45.56 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  38.21 
 
 		 416 aa  238  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  34.97 
 
 		 416 aa  237  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  48.03 
 
 		 416 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  35.73 
 
 		 405 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  35.82 
 
 		 405 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  46.47 
 
 		 244 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  35.54 
 
 		 409 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  36.5 
 
 		 421 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  45.49 
 
 		 418 aa  234  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  38.79 
 
 		 423 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  36.25 
 
 		 421 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  43.78 
 
 		 429 aa  233  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  48.39 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  44.75 
 
 		 429 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  45.38 
 
 		 400 aa  231  3e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  45.8 
 
 		 429 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  35.08 
 
 		 424 aa  231  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  47.18 
 
 		 250 aa  231  4e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  45.6 
 
 		 421 aa  231  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  44.21 
 
 		 254 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  45.69 
 
 		 439 aa  229  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  44.54 
 
 		 424 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  42.12 
 
 		 418 aa  229  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 		 422 aa  229  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  48.13 
 
 		 439 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  50 
 
 		 428 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  33.73 
 
 		 407 aa  228  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  43.75 
 
 		 420 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  42.55 
 
 		 411 aa  227  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.58 
 
 		 415 aa  226  9e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  45.16 
 
 		 422 aa  226  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  43.25 
 
 		 420 aa  226  9e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  41.91 
 
 		 422 aa  226  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  48.51 
 
 		 369 aa  225  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  47.37 
 
 		 422 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  43.07 
 
 		 437 aa  225  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  43.95 
 
 		 418 aa  224  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  42.58 
 
 		 427 aa  224  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.95 
 
 		 417 aa  223  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  47.44 
 
 		 247 aa  223  9e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  43.8 
 
 		 429 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  49.75 
 
 		 428 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  44.4 
 
 		 427 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  38.46 
 
 		 408 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2170  putative ABC transporter  46.61 
 
 		 431 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  43.03 
 
 		 412 aa  221  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  42.62 
 
 		 246 aa  221  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  35.69 
 
 		 402 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>