More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3774 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  100 
 
 
256 aa  517  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  64.68 
 
 
258 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  63.37 
 
 
255 aa  299  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  64.14 
 
 
258 aa  297  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  64.71 
 
 
266 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  52.89 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  54.47 
 
 
268 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  45.06 
 
 
249 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  36.63 
 
 
248 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
260 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  39.15 
 
 
251 aa  160  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  35.9 
 
 
251 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  36.75 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  34.76 
 
 
241 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  34.19 
 
 
249 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  33.61 
 
 
249 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  37.34 
 
 
249 aa  144  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  32.64 
 
 
241 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  32.64 
 
 
241 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  38.94 
 
 
211 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  32.38 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  32.38 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  32.64 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  32.64 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  32.79 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  31.95 
 
 
241 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  32.23 
 
 
246 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  32.23 
 
 
246 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  32.23 
 
 
246 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
248 aa  139  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  32.23 
 
 
246 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  32.23 
 
 
246 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  31.98 
 
 
246 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  33.33 
 
 
254 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  32.48 
 
 
240 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  33.33 
 
 
247 aa  133  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  31.98 
 
 
254 aa  132  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  33.61 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  33.48 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  37.55 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  29.2 
 
 
254 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  29.46 
 
 
243 aa  123  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  35.4 
 
 
249 aa  122  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  31.43 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  30.22 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  27.23 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  36.32 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  30.7 
 
 
237 aa  113  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  28 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  36.24 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  31.11 
 
 
235 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  30.09 
 
 
220 aa  108  1e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  29.49 
 
 
233 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  27.01 
 
 
231 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  27.95 
 
 
235 aa  100  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  28.19 
 
 
233 aa  99.8  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  30.13 
 
 
260 aa  99  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  29.43 
 
 
398 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  30.65 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  29.13 
 
 
237 aa  97.8  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  26.59 
 
 
338 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  29.06 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  30.49 
 
 
253 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  27.31 
 
 
233 aa  95.9  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  27.31 
 
 
233 aa  95.5  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  25.64 
 
 
231 aa  95.5  8e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  31.42 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  30.7 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  31.92 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  30.17 
 
 
223 aa  92  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  32.29 
 
 
222 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  28.72 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  32.16 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
216 aa  89.7  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
216 aa  88.6  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  27.44 
 
 
230 aa  88.6  9e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  29.79 
 
 
250 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  31.36 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  31.36 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  28.44 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  30.9 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  31.9 
 
 
260 aa  86.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  30.77 
 
 
259 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  41.53 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  30.73 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  22.73 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  30.05 
 
 
245 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  28.69 
 
 
263 aa  79  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.05 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  30.05 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  30.05 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  30.05 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  30.05 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  30.05 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  32.46 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  30.33 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  30.05 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  29.53 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  31.66 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  26.91 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>