More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3749 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  65.05 
 
 
505 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  64.37 
 
 
507 aa  671    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  62.42 
 
 
508 aa  648    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  65 
 
 
507 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  100 
 
 
510 aa  1043    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  68.24 
 
 
507 aa  706    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  55.64 
 
 
515 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  61.23 
 
 
513 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  55.01 
 
 
516 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  58.66 
 
 
525 aa  579  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  56.11 
 
 
510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  56.72 
 
 
509 aa  557  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  53.68 
 
 
515 aa  535  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  51.06 
 
 
520 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  45.08 
 
 
532 aa  451  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  46.94 
 
 
504 aa  448  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  45.03 
 
 
720 aa  399  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.93 
 
 
475 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.72 
 
 
475 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.86 
 
 
713 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  40.04 
 
 
713 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  43.1 
 
 
704 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.61 
 
 
712 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44 
 
 
472 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.61 
 
 
717 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  40.28 
 
 
716 aa  364  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.16 
 
 
746 aa  363  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  40.57 
 
 
716 aa  362  6e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.94 
 
 
473 aa  362  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  40.16 
 
 
738 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  40.24 
 
 
717 aa  353  4e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  43.2 
 
 
722 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.05 
 
 
473 aa  347  4e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.61 
 
 
717 aa  345  8.999999999999999e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  42.51 
 
 
486 aa  342  7e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.77 
 
 
472 aa  339  8e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.58 
 
 
482 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.47 
 
 
722 aa  336  5e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.47 
 
 
722 aa  335  9e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.93 
 
 
488 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40 
 
 
480 aa  332  9e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.46 
 
 
495 aa  329  7e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.05 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.32 
 
 
508 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.79 
 
 
471 aa  318  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.77 
 
 
705 aa  316  7e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.51 
 
 
474 aa  310  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  42.65 
 
 
472 aa  307  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.72 
 
 
475 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  42.71 
 
 
470 aa  306  7e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.58 
 
 
484 aa  297  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.91 
 
 
482 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  37.11 
 
 
714 aa  290  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  37.33 
 
 
714 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.36 
 
 
470 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19949  predicted protein  43.01 
 
 
393 aa  281  3e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0084  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.24 
 
 
473 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.06 
 
 
482 aa  277  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  36.12 
 
 
546 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  35.73 
 
 
546 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  41.14 
 
 
470 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0732  mercuric reductase, putative  34.03 
 
 
489 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000844078  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  33.4 
 
 
546 aa  270  5e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  33.4 
 
 
546 aa  270  7e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.7 
 
 
470 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  34.23 
 
 
499 aa  269  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  34.95 
 
 
550 aa  266  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  36.36 
 
 
458 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3385  putative mercuric reductase protein  36.95 
 
 
477 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329574  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  36.36 
 
 
458 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  36.68 
 
 
557 aa  264  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0664  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.57 
 
 
489 aa  261  1e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150999  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  35.48 
 
 
459 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  35.7 
 
 
459 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  35.7 
 
 
459 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.18 
 
 
458 aa  257  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  35.7 
 
 
459 aa  258  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  35.16 
 
 
475 aa  257  4e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  35.16 
 
 
459 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.29 
 
 
456 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  34.65 
 
 
459 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  34.65 
 
 
459 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  34.95 
 
 
548 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  34.37 
 
 
459 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  35.02 
 
 
767 aa  249  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  34.59 
 
 
459 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  31.79 
 
 
460 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.51 
 
 
472 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.16 
 
 
459 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  32.89 
 
 
458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  33.92 
 
 
459 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  33.48 
 
 
460 aa  244  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  34.42 
 
 
745 aa  242  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  34.36 
 
 
453 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  32.59 
 
 
459 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  32.59 
 
 
459 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  32.59 
 
 
459 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  32.75 
 
 
459 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  31.74 
 
 
469 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2327  acetoin dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  32.46 
 
 
450 aa  237  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>